Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN1MW3P0DN78 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN1MW3P0DN78 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OPN1MW3P0DN78 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN1MW3P0DN78 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OPN1MW3P0DN78 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OPN1MW3P0DN78 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OPN1MW3P0DN78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms