Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMBP08118 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSMBP08118 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMBP08118 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMBP08118 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSMBP08118 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSMBP08118 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSMBP08118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSMBP08118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSMBP08118 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSMBP08118 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSMBP08118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSMBP08118 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSMBP08118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMBP08118 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMBP08118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMBP08118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMBP08118 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSMBP08118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMBP08118 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMBP08118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMBP08118 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSMBP08118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSMBP08118 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSMBP08118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSMBP08118 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSMBP08118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSMBP08118 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSMBP08118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMBP08118 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMBP08118 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMBP08118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSMBP08118 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMBP08118 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSMBP08118 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSMBP08118 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMBP08118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMBP08118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMBP08118 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSMBP08118 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMBP08118 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMBP08118 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSMBP08118 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMBP08118 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSMBP08118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSMBP08118 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSMBP08118 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSMBP08118 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSMBP08118 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMBP08118 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMBP08118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMBP08118 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMBP08118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSMBP08118 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSMBP08118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSMBP08118 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSMBP08118 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMBP08118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMBP08118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMBP08118 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMBP08118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMBP08118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMBP08118 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMBP08118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMBP08118 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMBP08118 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMBP08118 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMBP08118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMBP08118 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMBP08118 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSMBP08118 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMBP08118 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMBP08118 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMBP08118 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMBP08118 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMBP08118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms