Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GJB1P08034 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GJB1P08034 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB1P08034 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GJB1P08034 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJB1P08034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GJB1P08034 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GJB1P08034 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJB1P08034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GJB1P08034 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GJB1P08034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB1P08034 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB1P08034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJB1P08034 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJB1P08034 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB1P08034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB1P08034 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJB1P08034 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJB1P08034 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJB1P08034 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJB1P08034 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJB1P08034 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJB1P08034 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GJB1P08034 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJB1P08034 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJB1P08034 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJB1P08034 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJB1P08034 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB1P08034 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJB1P08034 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB1P08034 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB1P08034 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJB1P08034 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJB1P08034 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJB1P08034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB1P08034 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJB1P08034 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB1P08034 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB1P08034 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB1P08034 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GJB1P08034 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJB1P08034 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJB1P08034 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJB1P08034 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GJB1P08034 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB1P08034 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJB1P08034 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJB1P08034 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJB1P08034 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJB1P08034 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB1P08034 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJB1P08034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJB1P08034 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GJB1P08034 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB1P08034 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB1P08034 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GJB1P08034 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJB1P08034 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GJB1P08034 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GJB1P08034 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GJB1P08034 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJB1P08034 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GJB1P08034 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GJB1P08034 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB1P08034 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB1P08034 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJB1P08034 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB1P08034 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB1P08034 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GJB1P08034 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB1P08034 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJB1P08034 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJB1P08034 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJB1P08034 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJB1P08034 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJB1P08034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJB1P08034 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJB1P08034 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB1P08034 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJB1P08034 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJB1P08034 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GJB1P08034 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
GJB1P08034 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB1P08034 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB1P08034 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GJB1P08034 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB1P08034 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJB1P08034 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB1P08034 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB1P08034 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJB1P08034 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GJB1P08034 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GJB1P08034 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB1P08034 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB1P08034 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GJB1P08034 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB1P08034 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB1P08034 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB1P08034 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJB1P08034 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms