Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1P04632 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1P04632 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1P04632 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1P04632 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1P04632 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPNS1P04632 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1P04632 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1P04632 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS1P04632 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1P04632 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1P04632 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms