Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRAMEF12O95522 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF12O95522 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF12O95522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF12O95522 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF12O95522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF12O95522 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAMEF12O95522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAMEF12O95522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF12O95522 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF12O95522 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF12O95522 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF12O95522 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF12O95522 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms