Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATE1O95260 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATE1O95260 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATE1O95260 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATE1O95260 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATE1O95260 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATE1O95260 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATE1O95260 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATE1O95260 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATE1O95260 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATE1O95260 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATE1O95260 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATE1O95260 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATE1O95260 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATE1O95260 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATE1O95260 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATE1O95260 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATE1O95260 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATE1O95260 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATE1O95260 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATE1O95260 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATE1O95260 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATE1O95260 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATE1O95260 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATE1O95260 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATE1O95260 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATE1O95260 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATE1O95260 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATE1O95260 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATE1O95260 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATE1O95260 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATE1O95260 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATE1O95260 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATE1O95260 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATE1O95260 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATE1O95260 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATE1O95260 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATE1O95260 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATE1O95260 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATE1O95260 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATE1O95260 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATE1O95260 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATE1O95260 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATE1O95260 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATE1O95260 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATE1O95260 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATE1O95260 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATE1O95260 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATE1O95260 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATE1O95260 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATE1O95260 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATE1O95260 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATE1O95260 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATE1O95260 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATE1O95260 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATE1O95260 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATE1O95260 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATE1O95260 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATE1O95260 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATE1O95260 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATE1O95260 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATE1O95260 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATE1O95260 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATE1O95260 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATE1O95260 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATE1O95260 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATE1O95260 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATE1O95260 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATE1O95260 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATE1O95260 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATE1O95260 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATE1O95260 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATE1O95260 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATE1O95260 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATE1O95260 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATE1O95260 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATE1O95260 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATE1O95260 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATE1O95260 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATE1O95260 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATE1O95260 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATE1O95260 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATE1O95260 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATE1O95260 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATE1O95260 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATE1O95260 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATE1O95260 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATE1O95260 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATE1O95260 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATE1O95260 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATE1O95260 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATE1O95260 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATE1O95260 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATE1O95260 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATE1O95260 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATE1O95260 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATE1O95260 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATE1O95260 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATE1O95260 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATE1O95260 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms