Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSTN1O94985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSTN1O94985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLSTN1O94985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLSTN1O94985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSTN1O94985 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSTN1O94985 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSTN1O94985 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLSTN1O94985 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLSTN1O94985 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms