Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPM1BO75688 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPM1BO75688 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPM1BO75688 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPM1BO75688 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1BO75688 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1BO75688 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPM1BO75688 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms