Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF40O75150 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF40O75150 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF40O75150 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF40O75150 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF40O75150 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF40O75150 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF40O75150 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF40O75150 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF40O75150 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF40O75150 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF40O75150 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF40O75150 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF40O75150 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF40O75150 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF40O75150 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF40O75150 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF40O75150 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF40O75150 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF40O75150 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF40O75150 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF40O75150 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF40O75150 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF40O75150 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF40O75150 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF40O75150 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF40O75150 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF40O75150 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF40O75150 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF40O75150 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF40O75150 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF40O75150 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF40O75150 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF40O75150 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF40O75150 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF40O75150 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF40O75150 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF40O75150 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF40O75150 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF40O75150 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF40O75150 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF40O75150 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF40O75150 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF40O75150 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF40O75150 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF40O75150 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF40O75150 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF40O75150 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF40O75150 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF40O75150 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF40O75150 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF40O75150 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF40O75150 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF40O75150 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms