Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE3O75131 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPNE3O75131 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE3O75131 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE3O75131 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPNE3O75131 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPNE3O75131 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPNE3O75131 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPNE3O75131 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPNE3O75131 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPNE3O75131 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPNE3O75131 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms