Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPXNO60711 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPXNO60711 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LPXNO60711 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPXNO60711 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPXNO60711 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPXNO60711 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPXNO60711 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LPXNO60711 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LPXNO60711 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPXNO60711 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LPXNO60711 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPXNO60711 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPXNO60711 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LPXNO60711 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LPXNO60711 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LPXNO60711 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LPXNO60711 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPXNO60711 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LPXNO60711 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPXNO60711 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LPXNO60711 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPXNO60711 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LPXNO60711 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LPXNO60711 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LPXNO60711 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LPXNO60711 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LPXNO60711 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LPXNO60711 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LPXNO60711 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LPXNO60711 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LPXNO60711 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LPXNO60711 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LPXNO60711 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LPXNO60711 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LPXNO60711 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LPXNO60711 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LPXNO60711 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LPXNO60711 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LPXNO60711 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LPXNO60711 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LPXNO60711 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LPXNO60711 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LPXNO60711 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LPXNO60711 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LPXNO60711 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LPXNO60711 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LPXNO60711 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LPXNO60711 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LPXNO60711 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms