Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF9O60383 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GDF9O60383 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF9O60383 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GDF9O60383 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GDF9O60383 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDF9O60383 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF9O60383 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF9O60383 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF9O60383 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GDF9O60383 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF9O60383 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF9O60383 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF9O60383 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF9O60383 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF9O60383 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF9O60383 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF9O60383 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF9O60383 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF9O60383 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF9O60383 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF9O60383 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF9O60383 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF9O60383 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF9O60383 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF9O60383 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF9O60383 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF9O60383 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF9O60383 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF9O60383 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF9O60383 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF9O60383 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF9O60383 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GDF9O60383 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF9O60383 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF9O60383 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF9O60383 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF9O60383 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF9O60383 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF9O60383 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF9O60383 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF9O60383 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDF9O60383 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF9O60383 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF9O60383 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF9O60383 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF9O60383 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GDF9O60383 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDF9O60383 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF9O60383 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF9O60383 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF9O60383 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF9O60383 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF9O60383 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF9O60383 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF9O60383 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF9O60383 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF9O60383 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF9O60383 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF9O60383 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF9O60383 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF9O60383 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF9O60383 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF9O60383 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF9O60383 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF9O60383 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF9O60383 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF9O60383 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF9O60383 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF9O60383 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF9O60383 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF9O60383 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF9O60383 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF9O60383 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF9O60383 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF9O60383 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF9O60383 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF9O60383 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF9O60383 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF9O60383 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF9O60383 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF9O60383 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF9O60383 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GDF9O60383 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF9O60383 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF9O60383 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF9O60383 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF9O60383 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF9O60383 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF9O60383 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF9O60383 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDF9O60383 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDF9O60383 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms