Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLX3O43711 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLX3O43711 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLX3O43711 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLX3O43711 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLX3O43711 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLX3O43711 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLX3O43711 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLX3O43711 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TLX3O43711 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TLX3O43711 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TLX3O43711 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLX3O43711 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TLX3O43711 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLX3O43711 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TLX3O43711 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLX3O43711 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TLX3O43711 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLX3O43711 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TLX3O43711 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TLX3O43711 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLX3O43711 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLX3O43711 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TLX3O43711 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLX3O43711 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TLX3O43711 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TLX3O43711 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TLX3O43711 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLX3O43711 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TLX3O43711 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TLX3O43711 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TLX3O43711 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLX3O43711 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLX3O43711 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLX3O43711 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLX3O43711 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLX3O43711 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLX3O43711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLX3O43711 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLX3O43711 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLX3O43711 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLX3O43711 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLX3O43711 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLX3O43711 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLX3O43711 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLX3O43711 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLX3O43711 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLX3O43711 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLX3O43711 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TLX3O43711 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TLX3O43711 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLX3O43711 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLX3O43711 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLX3O43711 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLX3O43711 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLX3O43711 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLX3O43711 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLX3O43711 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLX3O43711 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLX3O43711 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLX3O43711 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TLX3O43711 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLX3O43711 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLX3O43711 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLX3O43711 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLX3O43711 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TLX3O43711 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TLX3O43711 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLX3O43711 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLX3O43711 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLX3O43711 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLX3O43711 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TLX3O43711 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TLX3O43711 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLX3O43711 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLX3O43711 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TLX3O43711 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLX3O43711 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLX3O43711 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TLX3O43711 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLX3O43711 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TLX3O43711 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TLX3O43711 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLX3O43711 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TLX3O43711 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TLX3O43711 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TLX3O43711 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TLX3O43711 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLX3O43711 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TLX3O43711 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLX3O43711 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TLX3O43711 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TLX3O43711 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TLX3O43711 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TLX3O43711 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms