Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DCXO43602 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DCXO43602 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DCXO43602 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DCXO43602 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DCXO43602 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DCXO43602 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DCXO43602 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DCXO43602 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCXO43602 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCXO43602 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DCXO43602 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DCXO43602 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DCXO43602 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DCXO43602 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCXO43602 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCXO43602 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCXO43602 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCXO43602 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCXO43602 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCXO43602 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCXO43602 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCXO43602 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCXO43602 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCXO43602 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCXO43602 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DCXO43602 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCXO43602 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DCXO43602 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCXO43602 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DCXO43602 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCXO43602 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DCXO43602 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCXO43602 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DCXO43602 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DCXO43602 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DCXO43602 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DCXO43602 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DCXO43602 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCXO43602 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCXO43602 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DCXO43602 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DCXO43602 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DCXO43602 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DCXO43602 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCXO43602 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DCXO43602 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DCXO43602 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DCXO43602 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DCXO43602 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DCXO43602 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DCXO43602 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DCXO43602 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DCXO43602 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DCXO43602 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DCXO43602 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCXO43602 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCXO43602 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCXO43602 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DCXO43602 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCXO43602 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCXO43602 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DCXO43602 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DCXO43602 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DCXO43602 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCXO43602 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCXO43602 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCXO43602 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCXO43602 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCXO43602 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCXO43602 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCXO43602 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCXO43602 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCXO43602 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCXO43602 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCXO43602 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DCXO43602 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DCXO43602 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCXO43602 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DCXO43602 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DCXO43602 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCXO43602 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DCXO43602 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCXO43602 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCXO43602 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DCXO43602 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCXO43602 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DCXO43602 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCXO43602 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DCXO43602 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCXO43602 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DCXO43602 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCXO43602 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCXO43602 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms