Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNQ3O43525 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNQ3O43525 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KCNQ3O43525 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KCNQ3O43525 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KCNQ3O43525 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KCNQ3O43525 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KCNQ3O43525 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KCNQ3O43525 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KCNQ3O43525 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KCNQ3O43525 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KCNQ3O43525 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KCNQ3O43525 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KCNQ3O43525 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
KCNQ3O43525 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
KCNQ3O43525 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KCNQ3O43525 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KCNQ3O43525 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms