Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA1GO43497 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA1GO43497 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CACNA1GO43497 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1GO43497 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1GO43497 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1GO43497 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA1GO43497 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA1GO43497 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1GO43497 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms