Protein–RNA interactions for Protein: O43361

ZNF749, Zinc finger protein 749, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF749O43361 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF749O43361 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF749O43361 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF749O43361 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF749O43361 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF749O43361 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF749O43361 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF749O43361 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF749O43361 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms