Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF208O43345 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF208O43345 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF208O43345 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF208O43345 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF208O43345 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF208O43345 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF208O43345 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms