Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MAP3K13O43283 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K13O43283 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MAP3K13O43283 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K13O43283 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K13O43283 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K13O43283 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K13O43283 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K13O43283 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K13O43283 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K13O43283 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K13O43283 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K13O43283 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K13O43283 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K13O43283 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K13O43283 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAP3K13O43283 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MAP3K13O43283 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K13O43283 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K13O43283 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAP3K13O43283 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms