Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 41.3
PRPF4O43172 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 41.3
PRPF4O43172 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 41.3
PRPF4O43172 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.371e-15■■■■■ 41.3
PRPF4O43172 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 41.2
PRPF4O43172 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 41.2
PRPF4O43172 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 41.2
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PRPF4O43172 SNRPE-203ENST00000469451 248 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-12■■■■■ 40.9
PRPF4O43172 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.852e-12■■■■■ 40.9
PRPF4O43172 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 40.9
PRPF4O43172 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.39□□□□□ -1.552e-12■■■■■ 40.9
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PRPF4O43172 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 313.68□□□□□ -0.224e-10■■■■■ 40.6
PRPF4O43172 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-11■■■■■ 40.5
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PRPF4O43172 CHTF8-211ENST00000567763 734 ntTSL 222.53■■□□□ 1.28e-8■■■■■ 40.5
PRPF4O43172 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.118e-8■■■■■ 40.5
PRPF4O43172 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 40.5
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PRPF4O43172 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 40.4
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PRPF4O43172 PIK3CB-204ENST00000462898 4747 ntTSL 517.5■□□□□ 0.391e-36■■■■■ 39.6
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PRPF4O43172 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 39.3
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