RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483968.5

PIK3CB-210, Transcript of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CB-210ENST00000483968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.13■■■■■ 6.58
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.23■■■■■ 5.63
PIK3CB-210ENST00000483968 ABCC9O60706 1549 aa49.81■■■■■ 5.56
PIK3CB-210ENST00000483968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.58■■■■■ 5.21
PIK3CB-210ENST00000483968 NACADO15069 1562 aa47.36■■■■■ 5.17
PIK3CB-210ENST00000483968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.07■■■■■ 5.13
PIK3CB-210ENST00000483968 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.85■■■■■ 5.09
PIK3CB-210ENST00000483968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.63■■■■■ 5.06
PIK3CB-210ENST00000483968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
PIK3CB-210ENST00000483968 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.41■■■■■ 5.02
PIK3CB-210ENST00000483968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.4■■■■■ 5.02
PIK3CB-210ENST00000483968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.39■■■■■ 5.02
PIK3CB-210ENST00000483968 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.26■■■■■ 5
PIK3CB-210ENST00000483968 SCRIBQ14160 1630 aa45.77■■■■■ 4.92
PIK3CB-210ENST00000483968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
PIK3CB-210ENST00000483968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.05■■■■■ 4.8
PIK3CB-210ENST00000483968 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
PIK3CB-210ENST00000483968 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.83■■■■■ 4.77
PIK3CB-210ENST00000483968 SMARCA4P51532 1647 aa43.73■■■■■ 4.59
PIK3CB-210ENST00000483968 NCAPD3P42695 1498 aa43.71■■■■■ 4.59
PIK3CB-210ENST00000483968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
PIK3CB-210ENST00000483968 SMARCA2P51531 1590 aa43.53■■■■■ 4.56
PIK3CB-210ENST00000483968 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
PIK3CB-210ENST00000483968 HMGXB3Q12766 1538 aa43.45■■■■■ 4.55
PIK3CB-210ENST00000483968 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.31■■■■■ 4.52
PIK3CB-210ENST00000483968 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.26■■■■■ 4.52
PIK3CB-210ENST00000483968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PIK3CB-210ENST00000483968 ERCC6Q03468 1493 aa42.94■■■■■ 4.46
PIK3CB-210ENST00000483968 NESP48681 1621 aa42.93■■■■■ 4.46
PIK3CB-210ENST00000483968 WIZO95785 1651 aa42.78■■■■■ 4.44
PIK3CB-210ENST00000483968 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
PIK3CB-210ENST00000483968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.68■■■■■ 4.42
PIK3CB-210ENST00000483968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
PIK3CB-210ENST00000483968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
PIK3CB-210ENST00000483968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.43■■■■■ 4.38
PIK3CB-210ENST00000483968 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.39■■■■■ 4.38
PIK3CB-210ENST00000483968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
PIK3CB-210ENST00000483968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.29■■■■■ 4.36
PIK3CB-210ENST00000483968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
PIK3CB-210ENST00000483968 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.02■■■■■ 4.32
PIK3CB-210ENST00000483968 CFTRP13569 1480 aa42.01■■■■■ 4.32
PIK3CB-210ENST00000483968 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
PIK3CB-210ENST00000483968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.92■■■■■ 4.3
PIK3CB-210ENST00000483968 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.92■■■■■ 4.3
PIK3CB-210ENST00000483968 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.74■■■■■ 4.27
PIK3CB-210ENST00000483968 PRDM2Q13029 1718 aa41.69■■■■■ 4.27
PIK3CB-210ENST00000483968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
PIK3CB-210ENST00000483968 TOPBP1Q92547 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
PIK3CB-210ENST00000483968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.08■■■■■ 4.17
PIK3CB-210ENST00000483968 ABCC8Q09428 1581 aa41.07■■■■■ 4.16
PIK3CB-210ENST00000483968 IFT140Q96RY7 1462 aa41.06■■■■■ 4.16
PIK3CB-210ENST00000483968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PIK3CB-210ENST00000483968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
PIK3CB-210ENST00000483968 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
PIK3CB-210ENST00000483968 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
PIK3CB-210ENST00000483968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
PIK3CB-210ENST00000483968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
PIK3CB-210ENST00000483968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.1
PIK3CB-210ENST00000483968 CUX1P39880 1505 aa40.63■■■■■ 4.1
PIK3CB-210ENST00000483968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.63■■■■■ 4.09
PIK3CB-210ENST00000483968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
PIK3CB-210ENST00000483968 TRIM41Q8WV44 630 aa40.56■■■■■ 4.08
PIK3CB-210ENST00000483968 SOGA1O94964 1423 aa40.56■■■■■ 4.08
PIK3CB-210ENST00000483968 CHD1O14646 1710 aa40.45■■■■■ 4.07
PIK3CB-210ENST00000483968 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
PIK3CB-210ENST00000483968 WDR97A6NE52 1622 aa40.4■■■■■ 4.06
PIK3CB-210ENST00000483968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
PIK3CB-210ENST00000483968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
PIK3CB-210ENST00000483968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.35■■■■■ 4.05
PIK3CB-210ENST00000483968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.26■■■■■ 4.03
PIK3CB-210ENST00000483968 ARHGEF11O15085 1522 aa40.25■■■■■ 4.03
PIK3CB-210ENST00000483968 FBLN2P98095 1184 aa40.22■■■■■ 4.03
PIK3CB-210ENST00000483968 GRIN2BQ13224 1484 aa40.18■■■■■ 4.02
PIK3CB-210ENST00000483968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PIK3CB-210ENST00000483968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.15■■■■■ 4.02
PIK3CB-210ENST00000483968 PBRM1Q86U86 1689 aa40.12■■■■■ 4.01
PIK3CB-210ENST00000483968 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.1■■■■■ 4.01
PIK3CB-210ENST00000483968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.09■■■■■ 4.01
PIK3CB-210ENST00000483968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.09■■■■■ 4.01
PIK3CB-210ENST00000483968 TOP2BQ02880 1626 aa40.08■■■■■ 4.01
PIK3CB-210ENST00000483968 SYNJ1O43426 1573 aa40.06■■■■■ 4
PIK3CB-210ENST00000483968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
PIK3CB-210ENST00000483968 SYNJ2O15056 1496 aa40.01■■■■■ 4
PIK3CB-210ENST00000483968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
PIK3CB-210ENST00000483968 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.99■■■■□ 3.99
PIK3CB-210ENST00000483968 ARAP1Q96P48 1450 aa39.89■■■■□ 3.98
PIK3CB-210ENST00000483968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.84■■■■□ 3.97
PIK3CB-210ENST00000483968 ADAMTS12P58397 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
PIK3CB-210ENST00000483968 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
PIK3CB-210ENST00000483968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.65■■■■□ 3.94
PIK3CB-210ENST00000483968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.59■■■■□ 3.93
PIK3CB-210ENST00000483968 CEP170Q5SW79 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
PIK3CB-210ENST00000483968 NUP160Q12769 1436 aa39.56■■■■□ 3.92
PIK3CB-210ENST00000483968 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.4■■■■□ 3.9
PIK3CB-210ENST00000483968 SHROOM2Q13796 1616 aa39.37■■■■□ 3.89
PIK3CB-210ENST00000483968 KIF27Q86VH2 1401 aa39.24■■■■□ 3.87
PIK3CB-210ENST00000483968 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
PIK3CB-210ENST00000483968 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
PIK3CB-210ENST00000483968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.19■■■■□ 3.86
PIK3CB-210ENST00000483968 CUL7Q14999 1698 aa39.15■■■■□ 3.86
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