RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567763.1

CHTF8-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF8, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF8-211ENST00000567763 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.59■■■■■ 7.13
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CHTF8-211ENST00000567763 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.5■■■■■ 6.16
CHTF8-211ENST00000567763 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.94■■■■■ 5.75
CHTF8-211ENST00000567763 NACADO15069 1562 aa50.54■■■■■ 5.68
CHTF8-211ENST00000567763 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.42■■■■■ 5.66
CHTF8-211ENST00000567763 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.28■■■■■ 5.64
CHTF8-211ENST00000567763 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.92■■■■■ 5.58
CHTF8-211ENST00000567763 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.92■■■■■ 5.58
CHTF8-211ENST00000567763 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.74■■■■■ 5.55
CHTF8-211ENST00000567763 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.49■■■■■ 5.51
CHTF8-211ENST00000567763 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
CHTF8-211ENST00000567763 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.13■■■■■ 5.45
CHTF8-211ENST00000567763 SCRIBQ14160 1630 aa48.88■■■■■ 5.42
CHTF8-211ENST00000567763 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.67■■■■■ 5.38
CHTF8-211ENST00000567763 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.42■■■■■ 5.34
CHTF8-211ENST00000567763 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
CHTF8-211ENST00000567763 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.25■■■■■ 5.31
CHTF8-211ENST00000567763 NCAPD3P42695 1498 aa46.63■■■■■ 5.06
CHTF8-211ENST00000567763 SMARCA4P51532 1647 aa46.55■■■■■ 5.04
CHTF8-211ENST00000567763 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.55■■■■■ 5.04
CHTF8-211ENST00000567763 SMARCA2P51531 1590 aa46.4■■■■■ 5.02
CHTF8-211ENST00000567763 HMGXB3Q12766 1538 aa46.33■■■■■ 5.01
CHTF8-211ENST00000567763 ERCC6Q03468 1493 aa46.28■■■■■ 5
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CHTF8-211ENST00000567763 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.1■■■■■ 4.97
CHTF8-211ENST00000567763 NESP48681 1621 aa46.07■■■■■ 4.97
CHTF8-211ENST00000567763 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.01■■■■■ 4.96
CHTF8-211ENST00000567763 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.97■■■■■ 4.95
CHTF8-211ENST00000567763 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.64■■■■■ 4.9
CHTF8-211ENST00000567763 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
CHTF8-211ENST00000567763 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.51■■■■■ 4.88
CHTF8-211ENST00000567763 WIZO95785 1651 aa45.47■■■■■ 4.87
CHTF8-211ENST00000567763 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.35■■■■■ 4.85
CHTF8-211ENST00000567763 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.24■■■■■ 4.83
CHTF8-211ENST00000567763 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.02■■■■■ 4.8
CHTF8-211ENST00000567763 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
CHTF8-211ENST00000567763 WDR62O43379 1518 aa44.91■■■■■ 4.78
CHTF8-211ENST00000567763 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
CHTF8-211ENST00000567763 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
CHTF8-211ENST00000567763 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.79■■■■■ 4.76
CHTF8-211ENST00000567763 CFTRP13569 1480 aa44.72■■■■■ 4.75
CHTF8-211ENST00000567763 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
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CHTF8-211ENST00000567763 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.32■■■■■ 4.69
CHTF8-211ENST00000567763 TRIM41Q8WV44 630 aa44.24■■■■■ 4.67
CHTF8-211ENST00000567763 OSCARQ8IYS5 282 aa43.99■■■■■ 4.63
CHTF8-211ENST00000567763 TOPBP1Q92547 1522 aa43.94■■■■■ 4.63
CHTF8-211ENST00000567763 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
CHTF8-211ENST00000567763 IFT140Q96RY7 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
CHTF8-211ENST00000567763 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.78■■■■■ 4.6
CHTF8-211ENST00000567763 ABCC8Q09428 1581 aa43.74■■■■■ 4.59
CHTF8-211ENST00000567763 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
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CHTF8-211ENST00000567763 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.55■■■■■ 4.56
CHTF8-211ENST00000567763 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.55■■■■■ 4.56
CHTF8-211ENST00000567763 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.51■■■■■ 4.56
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CHTF8-211ENST00000567763 CHD1O14646 1710 aa43.43■■■■■ 4.54
CHTF8-211ENST00000567763 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.38■■■■■ 4.54
CHTF8-211ENST00000567763 ARHGEF11O15085 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
CHTF8-211ENST00000567763 SOGA1O94964 1423 aa43.27■■■■■ 4.52
CHTF8-211ENST00000567763 FBLN2P98095 1184 aa43.26■■■■■ 4.52
CHTF8-211ENST00000567763 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.25■■■■■ 4.51
CHTF8-211ENST00000567763 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
CHTF8-211ENST00000567763 CUX1P39880 1505 aa43.21■■■■■ 4.51
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CHTF8-211ENST00000567763 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
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CHTF8-211ENST00000567763 WDR97A6NE52 1622 aa43.02■■■■■ 4.48
CHTF8-211ENST00000567763 ARAP1Q96P48 1450 aa42.95■■■■■ 4.47
CHTF8-211ENST00000567763 GRIN2BQ13224 1484 aa42.89■■■■■ 4.46
CHTF8-211ENST00000567763 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
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CHTF8-211ENST00000567763 PBRM1Q86U86 1689 aa42.84■■■■■ 4.45
CHTF8-211ENST00000567763 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.82■■■■■ 4.45
CHTF8-211ENST00000567763 SYNJ1O43426 1573 aa42.8■■■■■ 4.44
CHTF8-211ENST00000567763 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.76■■■■■ 4.44
CHTF8-211ENST00000567763 SYNJ2O15056 1496 aa42.75■■■■■ 4.43
CHTF8-211ENST00000567763 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.68■■■■■ 4.42
CHTF8-211ENST00000567763 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.68■■■■■ 4.42
CHTF8-211ENST00000567763 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
CHTF8-211ENST00000567763 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.5■■■■■ 4.39
CHTF8-211ENST00000567763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.49■■■■■ 4.39
CHTF8-211ENST00000567763 TOP2BQ02880 1626 aa42.47■■■■■ 4.39
CHTF8-211ENST00000567763 ADAMTS12P58397 1594 aa42.39■■■■■ 4.38
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CHTF8-211ENST00000567763 CEP170Q5SW79 1584 aa42.27■■■■■ 4.36
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CHTF8-211ENST00000567763 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.18■■■■■ 4.34
CHTF8-211ENST00000567763 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.15■■■■■ 4.34
CHTF8-211ENST00000567763 SHROOM2Q13796 1616 aa42.04■■■■■ 4.32
CHTF8-211ENST00000567763 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
CHTF8-211ENST00000567763 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.79■■■■■ 4.28
CHTF8-211ENST00000567763 JPH4Q96JJ6 628 aa41.74■■■■■ 4.27
CHTF8-211ENST00000567763 KIF27Q86VH2 1401 aa41.61■■■■■ 4.25
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