Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRP8O43159 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP8O43159 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRP8O43159 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP8O43159 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP8O43159 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RRP8O43159 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP8O43159 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRP8O43159 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP8O43159 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRP8O43159 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP8O43159 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP8O43159 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRP8O43159 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRP8O43159 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP8O43159 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRP8O43159 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP8O43159 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP8O43159 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRP8O43159 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRP8O43159 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRP8O43159 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRP8O43159 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRP8O43159 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRP8O43159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRP8O43159 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP8O43159 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRP8O43159 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP8O43159 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRP8O43159 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP8O43159 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP8O43159 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRP8O43159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP8O43159 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP8O43159 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP8O43159 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP8O43159 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP8O43159 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP8O43159 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP8O43159 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP8O43159 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP8O43159 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP8O43159 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP8O43159 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP8O43159 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP8O43159 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP8O43159 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP8O43159 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP8O43159 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP8O43159 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP8O43159 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP8O43159 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP8O43159 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP8O43159 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP8O43159 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP8O43159 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP8O43159 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP8O43159 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP8O43159 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP8O43159 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRP8O43159 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP8O43159 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP8O43159 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRP8O43159 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP8O43159 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP8O43159 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRP8O43159 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRP8O43159 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP8O43159 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRP8O43159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP8O43159 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP8O43159 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP8O43159 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP8O43159 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP8O43159 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP8O43159 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP8O43159 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP8O43159 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP8O43159 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP8O43159 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP8O43159 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP8O43159 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP8O43159 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP8O43159 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP8O43159 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP8O43159 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP8O43159 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP8O43159 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP8O43159 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP8O43159 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP8O43159 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP8O43159 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP8O43159 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP8O43159 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP8O43159 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP8O43159 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP8O43159 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP8O43159 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP8O43159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP8O43159 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms