Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLXNB1O43157 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLXNB1O43157 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXNB1O43157 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLXNB1O43157 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNB1O43157 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNB1O43157 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLXNB1O43157 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLXNB1O43157 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms