Protein–RNA interactions for Protein: O15393

TMPRSS2, Transmembrane protease serine 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2O15393 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMPRSS2O15393 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS2O15393 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPRSS2O15393 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPRSS2O15393 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMPRSS2O15393 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS2O15393 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPRSS2O15393 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMPRSS2O15393 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMPRSS2O15393 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS2O15393 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS2O15393 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms