Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNPHO15079 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNPHO15079 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNPHO15079 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNPHO15079 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNPHO15079 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNPHO15079 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNPHO15079 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNPHO15079 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNPHO15079 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNPHO15079 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNPHO15079 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNPHO15079 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNPHO15079 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNPHO15079 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNPHO15079 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNPHO15079 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNPHO15079 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNPHO15079 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNPHO15079 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNPHO15079 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNPHO15079 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNPHO15079 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNPHO15079 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNPHO15079 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNPHO15079 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNPHO15079 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNPHO15079 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNPHO15079 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNPHO15079 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNPHO15079 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNPHO15079 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNPHO15079 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNPHO15079 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNPHO15079 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNPHO15079 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNPHO15079 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNPHO15079 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNPHO15079 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNPHO15079 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNPHO15079 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNPHO15079 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNPHO15079 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNPHO15079 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNPHO15079 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNPHO15079 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNPHO15079 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNPHO15079 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNPHO15079 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNPHO15079 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNPHO15079 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNPHO15079 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNPHO15079 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNPHO15079 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNPHO15079 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNPHO15079 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNPHO15079 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNPHO15079 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNPHO15079 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNPHO15079 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNPHO15079 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNPHO15079 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNPHO15079 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNPHO15079 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNPHO15079 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNPHO15079 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNPHO15079 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNPHO15079 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNPHO15079 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNPHO15079 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNPHO15079 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNPHO15079 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNPHO15079 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNPHO15079 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNPHO15079 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNPHO15079 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNPHO15079 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNPHO15079 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNPHO15079 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNPHO15079 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNPHO15079 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNPHO15079 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNPHO15079 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNPHO15079 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNPHO15079 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNPHO15079 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNPHO15079 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNPHO15079 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNPHO15079 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNPHO15079 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNPHO15079 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNPHO15079 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNPHO15079 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNPHO15079 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNPHO15079 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNPHO15079 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNPHO15079 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNPHO15079 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNPHO15079 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNPHO15079 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms