Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
N4BP3O15049 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
N4BP3O15049 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
N4BP3O15049 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
N4BP3O15049 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
N4BP3O15049 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
N4BP3O15049 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
N4BP3O15049 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
N4BP3O15049 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
N4BP3O15049 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
N4BP3O15049 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
N4BP3O15049 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
N4BP3O15049 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms