Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
POLR3AO14802 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
POLR3AO14802 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
POLR3AO14802 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR3AO14802 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR3AO14802 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLR3AO14802 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLR3AO14802 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLR3AO14802 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLR3AO14802 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
POLR3AO14802 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR3AO14802 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
POLR3AO14802 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
POLR3AO14802 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
POLR3AO14802 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
POLR3AO14802 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
POLR3AO14802 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms