Protein–RNA interactions for Protein: K9M1U5

IFNL4, Interferon lambda-4, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL4K9M1U5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNL4K9M1U5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNL4K9M1U5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFNL4K9M1U5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFNL4K9M1U5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL4K9M1U5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNL4K9M1U5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNL4K9M1U5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL4K9M1U5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms