Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BNC9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BNC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BNC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BNC9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BNC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BNC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H3BNC9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H3BNC9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BNC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BNC9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H3BNC9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H3BNC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H3BNC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H3BNC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BNC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BNC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BNC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BNC9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H3BNC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
H3BNC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BNC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H3BNC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
H3BNC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BNC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BNC9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H3BNC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BNC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
H3BNC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H3BNC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H3BNC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BNC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BNC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H3BNC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BNC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BNC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H3BNC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
H3BNC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H3BNC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H3BNC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BNC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BNC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BNC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
H3BNC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BNC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BNC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
H3BNC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
H3BNC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
H3BNC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
H3BNC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
H3BNC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
H3BNC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
H3BNC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BNC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H3BNC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BNC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BNC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
H3BNC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BNC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BNC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BNC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H3BNC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BNC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BNC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BNC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BNC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
H3BNC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BNC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BNC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BNC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BNC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BNC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BNC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BNC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BNC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H3BNC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BNC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BNC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BNC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BNC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
H3BNC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BNC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BNC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BNC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
H3BNC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
H3BNC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
H3BNC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
H3BNC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H3BNC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29■■■□□ 2.23
H3BNC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BNC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
H3BNC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BNC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BNC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BNC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BNC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BNC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
H3BNC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
H3BNC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BNC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms