Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF878C9JN71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF878C9JN71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF878C9JN71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF878C9JN71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF878C9JN71 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF878C9JN71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF878C9JN71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF878C9JN71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms