Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH8

HNRNPCL2, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL2B2RXH8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HNRNPCL2B2RXH8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HNRNPCL2B2RXH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HNRNPCL2B2RXH8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HNRNPCL2B2RXH8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNRNPCL2B2RXH8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HNRNPCL2B2RXH8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HNRNPCL2B2RXH8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HNRNPCL2B2RXH8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HNRNPCL2B2RXH8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HNRNPCL2B2RXH8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HNRNPCL2B2RXH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HNRNPCL2B2RXH8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms