Protein–RNA interactions for Protein: A8K2U0

A2ML1, Alpha-2-macroglobulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A2ML1A8K2U0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
A2ML1A8K2U0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
A2ML1A8K2U0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
A2ML1A8K2U0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
A2ML1A8K2U0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
A2ML1A8K2U0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
A2ML1A8K2U0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.01■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.01■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
A2ML1A8K2U0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
A2ML1A8K2U0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
A2ML1A8K2U0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
A2ML1A8K2U0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
A2ML1A8K2U0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
A2ML1A8K2U0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
A2ML1A8K2U0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
A2ML1A8K2U0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
A2ML1A8K2U0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
A2ML1A8K2U0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
A2ML1A8K2U0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms