Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SOBPA7XYQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOBPA7XYQ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOBPA7XYQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOBPA7XYQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOBPA7XYQ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOBPA7XYQ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOBPA7XYQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOBPA7XYQ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
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