Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELOA3DA6NLF2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ELOA3DA6NLF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ELOA3DA6NLF2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ELOA3DA6NLF2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELOA3DA6NLF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELOA3DA6NLF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELOA3DA6NLF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOA3DA6NLF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms