Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT87PA6NCN2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT87PA6NCN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT87PA6NCN2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT87PA6NCN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT87PA6NCN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT87PA6NCN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT87PA6NCN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT87PA6NCN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms