Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM30CPA0ZSE6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30CPA0ZSE6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM30CPA0ZSE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM30CPA0ZSE6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30CPA0ZSE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30CPA0ZSE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms