Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PRG6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PRG6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PRG6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PRG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PRG6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PRG6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1W2PRG6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PRG6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PRG6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms