Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ARID3CA6NKF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ARID3CA6NKF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ARID3CA6NKF2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms