RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.58■■■■■ 5.85
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STX4-201ENST00000313843 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
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STX4-201ENST00000313843 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.66■■■■■ 4.42
STX4-201ENST00000313843 NACADO15069 1562 aa42.5■■■■■ 4.39
STX4-201ENST00000313843 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.44■■■■■ 4.39
STX4-201ENST00000313843 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.38■■■■■ 4.37
STX4-201ENST00000313843 SCRIBQ14160 1630 aa41.67■■■■■ 4.26
STX4-201ENST00000313843 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.61■■■■■ 4.25
STX4-201ENST00000313843 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
STX4-201ENST00000313843 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.06■■■■■ 4.16
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STX4-201ENST00000313843 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.11■■■■■ 4.01
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STX4-201ENST00000313843 SMARCA4P51532 1647 aa39.89■■■■□ 3.98
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STX4-201ENST00000313843 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.57■■■■□ 3.93
STX4-201ENST00000313843 WIZO95785 1651 aa39.53■■■■□ 3.92
STX4-201ENST00000313843 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.41■■■■□ 3.9
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STX4-201ENST00000313843 NCAPD3P42695 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
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STX4-201ENST00000313843 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.06■■■■□ 3.68
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STX4-201ENST00000313843 CFTRP13569 1480 aa38.03■■■■□ 3.68
STX4-201ENST00000313843 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.79■■■■□ 3.64
STX4-201ENST00000313843 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.72■■■■□ 3.63
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STX4-201ENST00000313843 ERCC6Q03468 1493 aa37.66■■■■□ 3.62
STX4-201ENST00000313843 ABCC8Q09428 1581 aa37.58■■■■□ 3.61
STX4-201ENST00000313843 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.56■■■■□ 3.6
STX4-201ENST00000313843 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
STX4-201ENST00000313843 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.35■■■■□ 3.57
STX4-201ENST00000313843 SYNJ1O43426 1573 aa37.33■■■■□ 3.57
STX4-201ENST00000313843 CUX1P39880 1505 aa37.31■■■■□ 3.56
STX4-201ENST00000313843 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.29■■■■□ 3.56
STX4-201ENST00000313843 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
STX4-201ENST00000313843 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.28■■■■□ 3.56
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STX4-201ENST00000313843 TOPBP1Q92547 1522 aa37.2■■■■□ 3.55
STX4-201ENST00000313843 CUX2O14529 1486 aa37.18■■■■□ 3.54
STX4-201ENST00000313843 WDR62O43379 1518 aa37.18■■■■□ 3.54
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STX4-201ENST00000313843 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.01■■■■□ 3.52
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STX4-201ENST00000313843 SOGA1O94964 1423 aa36.76■■■■□ 3.48
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STX4-201ENST00000313843 IFT140Q96RY7 1462 aa36.74■■■■□ 3.47
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STX4-201ENST00000313843 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.55■■■■□ 3.44
STX4-201ENST00000313843 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.52■■■■□ 3.44
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STX4-201ENST00000313843 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
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STX4-201ENST00000313843 GRIN2BQ13224 1484 aa36.24■■■■□ 3.39
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STX4-201ENST00000313843 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.18■■■■□ 3.38
STX4-201ENST00000313843 IGF1RP08069 1367 aa36.17■■■■□ 3.38
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STX4-201ENST00000313843 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.1■■■■□ 3.37
STX4-201ENST00000313843 ADAMTS12P58397 1594 aa36.09■■■■□ 3.37
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STX4-201ENST00000313843 GOLGA3Q08378 1498 aa35.88■■■■□ 3.33
STX4-201ENST00000313843 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.82■■■■□ 3.32
STX4-201ENST00000313843 GRIN2AQ12879 1464 aa35.79■■■■□ 3.32
STX4-201ENST00000313843 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.74■■■■□ 3.31
STX4-201ENST00000313843 CEP170Q5SW79 1584 aa35.65■■■■□ 3.3
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