RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439725.5

H19-210, H19, imprinted maternally expressed transcript, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene H19, Length 1,929 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H19-210ENST00000439725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.37■■■■■ 5.81
H19-210ENST00000439725 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.77■■■■■ 4.76
H19-210ENST00000439725 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
H19-210ENST00000439725 ABCC9O60706 1549 aa42.43■■■■■ 4.38
H19-210ENST00000439725 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.4■■■■■ 4.38
H19-210ENST00000439725 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.4■■■■■ 4.38
H19-210ENST00000439725 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.98■■■■■ 4.31
H19-210ENST00000439725 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.87■■■■■ 4.29
H19-210ENST00000439725 NACADO15069 1562 aa41.66■■■■■ 4.26
H19-210ENST00000439725 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.32■■■■■ 4.21
H19-210ENST00000439725 SCRIBQ14160 1630 aa41.27■■■■■ 4.2
H19-210ENST00000439725 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.69■■■■■ 4.1
H19-210ENST00000439725 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
H19-210ENST00000439725 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.22■■■■■ 4.03
H19-210ENST00000439725 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.01■■■■■ 4
H19-210ENST00000439725 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.01■■■■□ 3.99
H19-210ENST00000439725 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
H19-210ENST00000439725 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.76■■■■□ 3.96
H19-210ENST00000439725 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
H19-210ENST00000439725 SMARCA4P51532 1647 aa39.52■■■■□ 3.92
H19-210ENST00000439725 WIZO95785 1651 aa39.46■■■■□ 3.91
H19-210ENST00000439725 PEG3Q9GZU2 1588 aa39■■■■□ 3.83
H19-210ENST00000439725 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
H19-210ENST00000439725 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
H19-210ENST00000439725 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.85■■■■□ 3.81
H19-210ENST00000439725 SMARCA2P51531 1590 aa38.76■■■■□ 3.8
H19-210ENST00000439725 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
H19-210ENST00000439725 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.59■■■■□ 3.77
H19-210ENST00000439725 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.58■■■■□ 3.77
H19-210ENST00000439725 NCAPD3P42695 1498 aa38.47■■■■□ 3.75
H19-210ENST00000439725 HMGXB3Q12766 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
H19-210ENST00000439725 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.4■■■■□ 3.74
H19-210ENST00000439725 ABCC8Q09428 1581 aa37.84■■■■□ 3.65
H19-210ENST00000439725 TRIM41Q8WV44 630 aa37.82■■■■□ 3.64
H19-210ENST00000439725 CFTRP13569 1480 aa37.64■■■■□ 3.62
H19-210ENST00000439725 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.57■■■■□ 3.61
H19-210ENST00000439725 PRDM2Q13029 1718 aa37.5■■■■□ 3.59
H19-210ENST00000439725 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.59
H19-210ENST00000439725 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.48■■■■□ 3.59
H19-210ENST00000439725 SYNJ1O43426 1573 aa37.44■■■■□ 3.58
H19-210ENST00000439725 NESP48681 1621 aa37.3■■■■□ 3.56
H19-210ENST00000439725 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
H19-210ENST00000439725 TOP2BQ02880 1626 aa37.21■■■■□ 3.55
H19-210ENST00000439725 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.19■■■■□ 3.54
H19-210ENST00000439725 CUX1P39880 1505 aa37.17■■■■□ 3.54
H19-210ENST00000439725 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.16■■■■□ 3.54
H19-210ENST00000439725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.16■■■■□ 3.54
H19-210ENST00000439725 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.11■■■■□ 3.53
H19-210ENST00000439725 SOGA1O94964 1423 aa37.09■■■■□ 3.53
H19-210ENST00000439725 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.01■■■■□ 3.52
H19-210ENST00000439725 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.85■■■■□ 3.49
H19-210ENST00000439725 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.85■■■■□ 3.49
H19-210ENST00000439725 EEA1Q15075 1411 aa36.83■■■■□ 3.49
H19-210ENST00000439725 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.82■■■■□ 3.48
H19-210ENST00000439725 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.77■■■■□ 3.48
H19-210ENST00000439725 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.77■■■■□ 3.48
H19-210ENST00000439725 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.73■■■■□ 3.47
H19-210ENST00000439725 TOPBP1Q92547 1522 aa36.73■■■■□ 3.47
H19-210ENST00000439725 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
H19-210ENST00000439725 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.69■■■■□ 3.46
H19-210ENST00000439725 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
H19-210ENST00000439725 KIF21BO75037 1637 aa36.48■■■■□ 3.43
H19-210ENST00000439725 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.48■■■■□ 3.43
H19-210ENST00000439725 KIF27Q86VH2 1401 aa36.48■■■■□ 3.43
H19-210ENST00000439725 CUX2O14529 1486 aa36.46■■■■□ 3.43
H19-210ENST00000439725 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.41■■■■□ 3.42
H19-210ENST00000439725 GOLGA3Q08378 1498 aa36.4■■■■□ 3.42
H19-210ENST00000439725 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.37■■■■□ 3.41
H19-210ENST00000439725 WDR97A6NE52 1622 aa36.35■■■■□ 3.41
H19-210ENST00000439725 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.32■■■■□ 3.4
H19-210ENST00000439725 PRXQ9BXM0 1461 aa36.3■■■■□ 3.4
H19-210ENST00000439725 ERCC6Q03468 1493 aa36.28■■■■□ 3.4
H19-210ENST00000439725 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.27■■■■□ 3.4
H19-210ENST00000439725 WDR62O43379 1518 aa36.26■■■■□ 3.4
H19-210ENST00000439725 IGF1RP08069 1367 aa36.22■■■■□ 3.39
H19-210ENST00000439725 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
H19-210ENST00000439725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
H19-210ENST00000439725 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
H19-210ENST00000439725 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.2■■■■□ 3.39
H19-210ENST00000439725 CEP162Q5TB80 1403 aa36.14■■■■□ 3.38
H19-210ENST00000439725 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.13■■■■□ 3.37
H19-210ENST00000439725 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
H19-210ENST00000439725 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.01■■■■□ 3.35
H19-210ENST00000439725 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.99■■■■□ 3.35
H19-210ENST00000439725 IFT140Q96RY7 1462 aa35.94■■■■□ 3.34
H19-210ENST00000439725 CUL7Q14999 1698 aa35.93■■■■□ 3.34
H19-210ENST00000439725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
H19-210ENST00000439725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.87■■■■□ 3.33
H19-210ENST00000439725 PBRM1Q86U86 1689 aa35.87■■■■□ 3.33
H19-210ENST00000439725 CLIP1P30622 1438 aa35.83■■■■□ 3.33
H19-210ENST00000439725 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
H19-210ENST00000439725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
H19-210ENST00000439725 GRIN2BQ13224 1484 aa35.69■■■■□ 3.3
H19-210ENST00000439725 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
H19-210ENST00000439725 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.59■■■■□ 3.29
H19-210ENST00000439725 ARAP1Q96P48 1450 aa35.57■■■■□ 3.28
H19-210ENST00000439725 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.56■■■■□ 3.28
H19-210ENST00000439725 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.54■■■■□ 3.28
H19-210ENST00000439725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.52■■■■□ 3.28
H19-210ENST00000439725 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms