RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.55■■■■■ 5.84
CTU2-201ENST00000312060 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.31■■■■■ 4.84
CTU2-201ENST00000312060 ABCC9O60706 1549 aa43.35■■■■■ 4.53
CTU2-201ENST00000312060 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
CTU2-201ENST00000312060 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.77■■■■■ 4.44
CTU2-201ENST00000312060 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.64■■■■■ 4.42
CTU2-201ENST00000312060 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.38■■■■■ 4.38
CTU2-201ENST00000312060 NACADO15069 1562 aa42.33■■■■■ 4.37
CTU2-201ENST00000312060 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.12■■■■■ 4.33
CTU2-201ENST00000312060 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.53■■■■■ 4.24
CTU2-201ENST00000312060 SCRIBQ14160 1630 aa41.51■■■■■ 4.24
CTU2-201ENST00000312060 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.3■■■■■ 4.2
CTU2-201ENST00000312060 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.82■■■■■ 4.13
CTU2-201ENST00000312060 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
CTU2-201ENST00000312060 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
CTU2-201ENST00000312060 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CTU2-201ENST00000312060 SMARCA4P51532 1647 aa39.78■■■■□ 3.96
CTU2-201ENST00000312060 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.78■■■■□ 3.96
CTU2-201ENST00000312060 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
CTU2-201ENST00000312060 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
CTU2-201ENST00000312060 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
CTU2-201ENST00000312060 WIZO95785 1651 aa39.45■■■■□ 3.91
CTU2-201ENST00000312060 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.32■■■■□ 3.89
CTU2-201ENST00000312060 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.26■■■■□ 3.87
CTU2-201ENST00000312060 SMARCA2P51531 1590 aa39.25■■■■□ 3.87
CTU2-201ENST00000312060 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.25■■■■□ 3.87
CTU2-201ENST00000312060 NCAPD3P42695 1498 aa39.04■■■■□ 3.84
CTU2-201ENST00000312060 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
CTU2-201ENST00000312060 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
CTU2-201ENST00000312060 HMGXB3Q12766 1538 aa38.94■■■■□ 3.82
CTU2-201ENST00000312060 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.78■■■■□ 3.8
CTU2-201ENST00000312060 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.59■■■■□ 3.77
CTU2-201ENST00000312060 CADPSQ9ULU8 1353 aa38■■■■□ 3.67
CTU2-201ENST00000312060 CFTRP13569 1480 aa37.99■■■■□ 3.67
CTU2-201ENST00000312060 PRDM2Q13029 1718 aa37.86■■■■□ 3.65
CTU2-201ENST00000312060 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.85■■■■□ 3.65
CTU2-201ENST00000312060 NESP48681 1621 aa37.85■■■■□ 3.65
CTU2-201ENST00000312060 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.63■■■■□ 3.62
CTU2-201ENST00000312060 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.57■■■■□ 3.6
CTU2-201ENST00000312060 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.56■■■■□ 3.6
CTU2-201ENST00000312060 ABCC8Q09428 1581 aa37.56■■■■□ 3.6
CTU2-201ENST00000312060 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.45■■■■□ 3.59
CTU2-201ENST00000312060 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.42■■■■□ 3.585e-6■■■■■ 29.2
CTU2-201ENST00000312060 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.41■■■■□ 3.58
CTU2-201ENST00000312060 TRIM41Q8WV44 630 aa37.37■■■■□ 3.57
CTU2-201ENST00000312060 SYNJ1O43426 1573 aa37.28■■■■□ 3.56
CTU2-201ENST00000312060 ERCC6Q03468 1493 aa37.25■■■■□ 3.55
CTU2-201ENST00000312060 CUX1P39880 1505 aa37.23■■■■□ 3.55
CTU2-201ENST00000312060 TOP2BQ02880 1626 aa37.21■■■■□ 3.55
CTU2-201ENST00000312060 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.2■■■■□ 3.55
CTU2-201ENST00000312060 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.13■■■■□ 3.53
CTU2-201ENST00000312060 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
CTU2-201ENST00000312060 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.1■■■■□ 3.53
CTU2-201ENST00000312060 TOPBP1Q92547 1522 aa37.09■■■■□ 3.53
CTU2-201ENST00000312060 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
CTU2-201ENST00000312060 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.94■■■■□ 3.5
CTU2-201ENST00000312060 WDR62O43379 1518 aa36.94■■■■□ 3.5
CTU2-201ENST00000312060 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
CTU2-201ENST00000312060 SOGA1O94964 1423 aa36.74■■■■□ 3.47
CTU2-201ENST00000312060 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.72■■■■□ 3.47
CTU2-201ENST00000312060 CUX2O14529 1486 aa36.65■■■■□ 3.46
CTU2-201ENST00000312060 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CTU2-201ENST00000312060 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.61■■■■□ 3.45
CTU2-201ENST00000312060 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.61■■■■□ 3.45
CTU2-201ENST00000312060 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CTU2-201ENST00000312060 WDR97A6NE52 1622 aa36.58■■■■□ 3.45
CTU2-201ENST00000312060 EEA1Q15075 1411 aa36.56■■■■□ 3.44
CTU2-201ENST00000312060 IFT140Q96RY7 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
CTU2-201ENST00000312060 KIF27Q86VH2 1401 aa36.54■■■■□ 3.44
CTU2-201ENST00000312060 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CTU2-201ENST00000312060 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.42■■■■□ 3.42
CTU2-201ENST00000312060 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.37■■■■□ 3.41
CTU2-201ENST00000312060 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CTU2-201ENST00000312060 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU2-201ENST00000312060 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.41e-7■■■■■ 27.3
CTU2-201ENST00000312060 IGF1RP08069 1367 aa36.27■■■■□ 3.4
CTU2-201ENST00000312060 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CTU2-201ENST00000312060 PBRM1Q86U86 1689 aa36.22■■■■□ 3.39
CTU2-201ENST00000312060 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.19■■■■□ 3.38
CTU2-201ENST00000312060 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.16■■■■□ 3.38
CTU2-201ENST00000312060 GRIN2BQ13224 1484 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU2-201ENST00000312060 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.12■■■■□ 3.37
CTU2-201ENST00000312060 KIF21BO75037 1637 aa36.12■■■■□ 3.37
CTU2-201ENST00000312060 CUL7Q14999 1698 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU2-201ENST00000312060 PRXQ9BXM0 1461 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU2-201ENST00000312060 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.08■■■■□ 3.37
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA3Q08378 1498 aa36■■■■□ 3.35
CTU2-201ENST00000312060 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36■■■■□ 3.35
CTU2-201ENST00000312060 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.97■■■■□ 3.35
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS12P58397 1594 aa35.94■■■■□ 3.34
CTU2-201ENST00000312060 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.93■■■■□ 3.34
CTU2-201ENST00000312060 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CTU2-201ENST00000312060 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CTU2-201ENST00000312060 SYNJ2O15056 1496 aa35.78■■■■□ 3.32
CTU2-201ENST00000312060 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.76■■■■□ 3.32
CTU2-201ENST00000312060 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
CTU2-201ENST00000312060 FBLN2P98095 1184 aa35.7■■■■□ 3.31
CTU2-201ENST00000312060 GRIN2AQ12879 1464 aa35.69■■■■□ 3.3
CTU2-201ENST00000312060 CHD1O14646 1710 aa35.63■■■■□ 3.29
CTU2-201ENST00000312060 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms