RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000374969.6

CERKL-203, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERKL, Length 1,330 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-203ENST00000374969 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.57■■■■■ 5.85
CERKL-203ENST00000374969 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.93■■■■■ 4.94
CERKL-203ENST00000374969 ABCC9O60706 1549 aa45.29■■■■■ 4.84
CERKL-203ENST00000374969 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.43■■■■■ 4.54
CERKL-203ENST00000374969 NACADO15069 1562 aa43.34■■■■■ 4.53
CERKL-203ENST00000374969 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.14■■■■■ 4.5
CERKL-203ENST00000374969 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.06■■■■■ 4.48
CERKL-203ENST00000374969 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
CERKL-203ENST00000374969 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.7■■■■■ 4.43
CERKL-203ENST00000374969 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.34■■■■■ 4.37
CERKL-203ENST00000374969 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.3■■■■■ 4.36
CERKL-203ENST00000374969 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.17■■■■■ 4.34
CERKL-203ENST00000374969 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.02■■■■■ 4.32
CERKL-203ENST00000374969 SCRIBQ14160 1630 aa41.83■■■■■ 4.29
CERKL-203ENST00000374969 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.76■■■■■ 4.27
CERKL-203ENST00000374969 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CERKL-203ENST00000374969 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.96■■■■■ 4.15
CERKL-203ENST00000374969 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.78■■■■■ 4.12
CERKL-203ENST00000374969 NCAPD3P42695 1498 aa40.06■■■■■ 4
CERKL-203ENST00000374969 SMARCA4P51532 1647 aa40.04■■■■■ 4
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CERKL-203ENST00000374969 SMARCA2P51531 1590 aa39.88■■■■□ 3.97
CERKL-203ENST00000374969 HMGXB3Q12766 1538 aa39.76■■■■□ 3.96
CERKL-203ENST00000374969 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.74■■■■□ 3.95
CERKL-203ENST00000374969 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.71■■■■□ 3.95
CERKL-203ENST00000374969 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
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CERKL-203ENST00000374969 NESP48681 1621 aa39.11■■■■□ 3.85
CERKL-203ENST00000374969 ERCC6Q03468 1493 aa39.05■■■■□ 3.84
CERKL-203ENST00000374969 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.97■■■■□ 3.83
CERKL-203ENST00000374969 CUX2O14529 1486 aa38.85■■■■□ 3.81
CERKL-203ENST00000374969 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.85■■■■□ 3.81
CERKL-203ENST00000374969 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
CERKL-203ENST00000374969 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.76■■■■□ 3.8
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CERKL-203ENST00000374969 CFTRP13569 1480 aa38.55■■■■□ 3.76
CERKL-203ENST00000374969 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.54■■■■□ 3.76
CERKL-203ENST00000374969 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.39■■■■□ 3.74
CERKL-203ENST00000374969 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.35■■■■□ 3.73
CERKL-203ENST00000374969 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.35■■■■□ 3.73
CERKL-203ENST00000374969 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.31■■■■□ 3.72
CERKL-203ENST00000374969 WDR62O43379 1518 aa38.25■■■■□ 3.71
CERKL-203ENST00000374969 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.15■■■■□ 3.7
CERKL-203ENST00000374969 PRDM2Q13029 1718 aa38.03■■■■□ 3.68
CERKL-203ENST00000374969 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
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CERKL-203ENST00000374969 ABCC8Q09428 1581 aa37.7■■■■□ 3.63
CERKL-203ENST00000374969 TOPBP1Q92547 1522 aa37.7■■■■□ 3.63
CERKL-203ENST00000374969 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.59■■■■□ 3.61
CERKL-203ENST00000374969 IFT140Q96RY7 1462 aa37.56■■■■□ 3.6
CERKL-203ENST00000374969 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
CERKL-203ENST00000374969 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CERKL-203ENST00000374969 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CERKL-203ENST00000374969 CUX1P39880 1505 aa37.27■■■■□ 3.56
CERKL-203ENST00000374969 SOGA1O94964 1423 aa37.21■■■■□ 3.55
CERKL-203ENST00000374969 OSCARQ8IYS5 282 aa37.2■■■■□ 3.55
CERKL-203ENST00000374969 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.19■■■■□ 3.54
CERKL-203ENST00000374969 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.18■■■■□ 3.54
CERKL-203ENST00000374969 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
CERKL-203ENST00000374969 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.54
CERKL-203ENST00000374969 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CERKL-203ENST00000374969 WDR97A6NE52 1622 aa37■■■■□ 3.51
CERKL-203ENST00000374969 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
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CERKL-203ENST00000374969 TOP2BQ02880 1626 aa36.84■■■■□ 3.49
CERKL-203ENST00000374969 GRIN2BQ13224 1484 aa36.81■■■■□ 3.48
CERKL-203ENST00000374969 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.81■■■■□ 3.48
CERKL-203ENST00000374969 SYNJ1O43426 1573 aa36.79■■■■□ 3.48
CERKL-203ENST00000374969 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.77■■■■□ 3.48
CERKL-203ENST00000374969 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.76■■■■□ 3.47
CERKL-203ENST00000374969 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
CERKL-203ENST00000374969 FBLN2P98095 1184 aa36.73■■■■□ 3.47
CERKL-203ENST00000374969 CHD1O14646 1710 aa36.72■■■■□ 3.47
CERKL-203ENST00000374969 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.69■■■■□ 3.46
CERKL-203ENST00000374969 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
CERKL-203ENST00000374969 SYNJ2O15056 1496 aa36.62■■■■□ 3.45
CERKL-203ENST00000374969 TRIM41Q8WV44 630 aa36.59■■■■□ 3.45
CERKL-203ENST00000374969 PBRM1Q86U86 1689 aa36.58■■■■□ 3.45
CERKL-203ENST00000374969 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.54■■■■□ 3.44
CERKL-203ENST00000374969 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.54■■■■□ 3.44
CERKL-203ENST00000374969 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.54■■■■□ 3.44
CERKL-203ENST00000374969 ARHGEF11O15085 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
CERKL-203ENST00000374969 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.44■■■■□ 3.42
CERKL-203ENST00000374969 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.4■■■■□ 3.42
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CERKL-203ENST00000374969 GRIN2AQ12879 1464 aa36.32■■■■□ 3.41
CERKL-203ENST00000374969 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.24■■■■□ 3.39
CERKL-203ENST00000374969 ARAP1Q96P48 1450 aa36.23■■■■□ 3.39
CERKL-203ENST00000374969 NUP160Q12769 1436 aa36.23■■■■□ 3.39
CERKL-203ENST00000374969 KIF27Q86VH2 1401 aa36.17■■■■□ 3.38
CERKL-203ENST00000374969 IGF1RP08069 1367 aa36.14■■■■□ 3.38
CERKL-203ENST00000374969 CEP170Q5SW79 1584 aa36.14■■■■□ 3.38
CERKL-203ENST00000374969 SHROOM2Q13796 1616 aa35.95■■■■□ 3.34
CERKL-203ENST00000374969 CUL7Q14999 1698 aa35.93■■■■□ 3.34
CERKL-203ENST00000374969 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.88■■■■□ 3.33
CERKL-203ENST00000374969 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.87■■■■□ 3.33
CERKL-203ENST00000374969 JPH4Q96JJ6 628 aa35.86■■■■□ 3.33
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