RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306750.3

NFS1-201, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFS1, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-201ENST00000306750 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.23■■■■■ 5.79
NFS1-201ENST00000306750 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.78■■■■■ 4.92
NFS1-201ENST00000306750 ABCC9O60706 1549 aa45.49■■■■■ 4.87
NFS1-201ENST00000306750 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.43■■■■■ 4.54
NFS1-201ENST00000306750 NACADO15069 1562 aa43.22■■■■■ 4.51
NFS1-201ENST00000306750 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.09■■■■■ 4.49
NFS1-201ENST00000306750 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.75■■■■■ 4.43
NFS1-201ENST00000306750 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
NFS1-201ENST00000306750 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.45■■■■■ 4.39
NFS1-201ENST00000306750 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
NFS1-201ENST00000306750 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.42■■■■■ 4.38
NFS1-201ENST00000306750 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.33■■■■■ 4.37
NFS1-201ENST00000306750 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.18■■■■■ 4.34
NFS1-201ENST00000306750 SCRIBQ14160 1630 aa41.75■■■■■ 4.27
NFS1-201ENST00000306750 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.61■■■■■ 4.25
NFS1-201ENST00000306750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.11■■■■■ 4.17
NFS1-201ENST00000306750 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
NFS1-201ENST00000306750 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.94■■■■■ 4.14
NFS1-201ENST00000306750 NCAPD3P42695 1498 aa39.92■■■■□ 3.98
NFS1-201ENST00000306750 SMARCA4P51532 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
NFS1-201ENST00000306750 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.85■■■■□ 3.97
NFS1-201ENST00000306750 SMARCA2P51531 1590 aa39.73■■■■□ 3.95
NFS1-201ENST00000306750 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
NFS1-201ENST00000306750 HMGXB3Q12766 1538 aa39.63■■■■□ 3.93
NFS1-201ENST00000306750 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.5■■■■□ 3.91
NFS1-201ENST00000306750 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.49■■■■□ 3.91
NFS1-201ENST00000306750 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
NFS1-201ENST00000306750 ERCC6Q03468 1493 aa39.23■■■■□ 3.87
NFS1-201ENST00000306750 NESP48681 1621 aa39.18■■■■□ 3.86
NFS1-201ENST00000306750 CUX2O14529 1486 aa39.05■■■■□ 3.84
NFS1-201ENST00000306750 WIZO95785 1651 aa39.01■■■■□ 3.84
NFS1-201ENST00000306750 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.94■■■■□ 3.82
NFS1-201ENST00000306750 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
NFS1-201ENST00000306750 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.72■■■■□ 3.79
NFS1-201ENST00000306750 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.72■■■■□ 3.79
NFS1-201ENST00000306750 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
NFS1-201ENST00000306750 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.68■■■■□ 3.78
NFS1-201ENST00000306750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.66■■■■□ 3.78
NFS1-201ENST00000306750 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
NFS1-201ENST00000306750 CFTRP13569 1480 aa38.35■■■■□ 3.73
NFS1-201ENST00000306750 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.35■■■■□ 3.73
NFS1-201ENST00000306750 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.27■■■■□ 3.72
NFS1-201ENST00000306750 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.27■■■■□ 3.72
NFS1-201ENST00000306750 WDR62O43379 1518 aa38.25■■■■□ 3.71
NFS1-201ENST00000306750 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.13■■■■□ 3.69
NFS1-201ENST00000306750 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
NFS1-201ENST00000306750 PRDM2Q13029 1718 aa37.95■■■■□ 3.67
NFS1-201ENST00000306750 TOPBP1Q92547 1522 aa37.59■■■■□ 3.61
NFS1-201ENST00000306750 ABCC8Q09428 1581 aa37.52■■■■□ 3.6
NFS1-201ENST00000306750 IFT140Q96RY7 1462 aa37.51■■■■□ 3.59
NFS1-201ENST00000306750 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.47■■■■□ 3.59
NFS1-201ENST00000306750 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
NFS1-201ENST00000306750 OSCARQ8IYS5 282 aa37.34■■■■□ 3.57
NFS1-201ENST00000306750 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
NFS1-201ENST00000306750 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
NFS1-201ENST00000306750 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
NFS1-201ENST00000306750 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
NFS1-201ENST00000306750 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.13■■■■□ 3.543e-6■■■□□ 15.6
NFS1-201ENST00000306750 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.1■■■■□ 3.53
NFS1-201ENST00000306750 TRIM41Q8WV44 630 aa37.1■■■■□ 3.53
NFS1-201ENST00000306750 SOGA1O94964 1423 aa37.08■■■■□ 3.53
NFS1-201ENST00000306750 CUX1P39880 1505 aa37.07■■■■□ 3.53
NFS1-201ENST00000306750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.04■■■■□ 3.52
NFS1-201ENST00000306750 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
NFS1-201ENST00000306750 CHD1O14646 1710 aa36.86■■■■□ 3.49
NFS1-201ENST00000306750 WDR97A6NE52 1622 aa36.85■■■■□ 3.49
NFS1-201ENST00000306750 FBLN2P98095 1184 aa36.81■■■■□ 3.48
NFS1-201ENST00000306750 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
NFS1-201ENST00000306750 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
NFS1-201ENST00000306750 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
NFS1-201ENST00000306750 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.75■■■■□ 3.47
NFS1-201ENST00000306750 ARHGEF11O15085 1522 aa36.73■■■■□ 3.47
NFS1-201ENST00000306750 GRIN2BQ13224 1484 aa36.7■■■■□ 3.47
NFS1-201ENST00000306750 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
NFS1-201ENST00000306750 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.64■■■■□ 3.46
NFS1-201ENST00000306750 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.62■■■■□ 3.45
NFS1-201ENST00000306750 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
NFS1-201ENST00000306750 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.45
NFS1-201ENST00000306750 TOP2BQ02880 1626 aa36.56■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.56■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 PBRM1Q86U86 1689 aa36.55■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.55■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 SYNJ2O15056 1496 aa36.54■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 SYNJ1O43426 1573 aa36.53■■■■□ 3.44
NFS1-201ENST00000306750 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.47■■■■□ 3.43
NFS1-201ENST00000306750 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.46■■■■□ 3.43
NFS1-201ENST00000306750 ARAP1Q96P48 1450 aa36.4■■■■□ 3.42
NFS1-201ENST00000306750 ADAMTS12P58397 1594 aa36.24■■■■□ 3.39
NFS1-201ENST00000306750 GRIN2AQ12879 1464 aa36.23■■■■□ 3.39
NFS1-201ENST00000306750 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
NFS1-201ENST00000306750 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.17■■■■□ 3.38
NFS1-201ENST00000306750 NUP160Q12769 1436 aa36.1■■■■□ 3.37
NFS1-201ENST00000306750 CEP170Q5SW79 1584 aa36.09■■■■□ 3.37
NFS1-201ENST00000306750 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.94■■■■□ 3.34
NFS1-201ENST00000306750 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
NFS1-201ENST00000306750 SHROOM2Q13796 1616 aa35.9■■■■□ 3.34
NFS1-201ENST00000306750 KIF27Q86VH2 1401 aa35.85■■■■□ 3.33
NFS1-201ENST00000306750 IGF1RP08069 1367 aa35.84■■■■□ 3.33
NFS1-201ENST00000306750 JPH4Q96JJ6 628 aa35.75■■■■□ 3.31
NFS1-201ENST00000306750 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms