RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366792.3

PARP1-202, Transcript of poly(ADP-ribose) polymerase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PARP1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1-202ENST00000366792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.23■■■■■ 5.79
PARP1-202ENST00000366792 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.61■■■■■ 4.89
PARP1-202ENST00000366792 ABCC9O60706 1549 aa44.79■■■■■ 4.76
PARP1-202ENST00000366792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43■■■■■ 4.47
PARP1-202ENST00000366792 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.93■■■■■ 4.46
PARP1-202ENST00000366792 NACADO15069 1562 aa42.9■■■■■ 4.46
PARP1-202ENST00000366792 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
PARP1-202ENST00000366792 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.56■■■■■ 4.4
PARP1-202ENST00000366792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.34■■■■■ 4.37
PARP1-202ENST00000366792 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.03■■■■■ 4.32
PARP1-202ENST00000366792 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.82■■■■■ 4.29
PARP1-202ENST00000366792 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.67■■■■■ 4.26
PARP1-202ENST00000366792 SCRIBQ14160 1630 aa41.66■■■■■ 4.26
PARP1-202ENST00000366792 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.21■■■■■ 4.19
PARP1-202ENST00000366792 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.16■■■■■ 4.18
PARP1-202ENST00000366792 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
PARP1-202ENST00000366792 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.49■■■■■ 4.07
PARP1-202ENST00000366792 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.24■■■■■ 4.03
PARP1-202ENST00000366792 SMARCA4P51532 1647 aa39.8■■■■□ 3.96
PARP1-202ENST00000366792 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
PARP1-202ENST00000366792 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.59■■■■□ 3.93
PARP1-202ENST00000366792 NCAPD3P42695 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
PARP1-202ENST00000366792 SMARCA2P51531 1590 aa39.55■■■■□ 3.92
PARP1-202ENST00000366792 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.49■■■■□ 3.91
PARP1-202ENST00000366792 HMGXB3Q12766 1538 aa39.38■■■■□ 3.89
PARP1-202ENST00000366792 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.36■■■■□ 3.89
PARP1-202ENST00000366792 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
PARP1-202ENST00000366792 WIZO95785 1651 aa39.09■■■■□ 3.85
PARP1-202ENST00000366792 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
PARP1-202ENST00000366792 NESP48681 1621 aa38.71■■■■□ 3.79
PARP1-202ENST00000366792 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
PARP1-202ENST00000366792 ERCC6Q03468 1493 aa38.63■■■■□ 3.77
PARP1-202ENST00000366792 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.57■■■■□ 3.77
PARP1-202ENST00000366792 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.42■■■■□ 3.74
PARP1-202ENST00000366792 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.32■■■■□ 3.73
PARP1-202ENST00000366792 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.27■■■■□ 3.72
PARP1-202ENST00000366792 CUX2O14529 1486 aa38.21■■■■□ 3.71
PARP1-202ENST00000366792 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.18■■■■□ 3.7
PARP1-202ENST00000366792 CFTRP13569 1480 aa38.16■■■■□ 3.7
PARP1-202ENST00000366792 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PARP1-202ENST00000366792 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.02■■■■□ 3.68
PARP1-202ENST00000366792 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.99■■■■□ 3.67
PARP1-202ENST00000366792 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
PARP1-202ENST00000366792 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.95■■■■□ 3.67
PARP1-202ENST00000366792 PRDM2Q13029 1718 aa37.92■■■■□ 3.66
PARP1-202ENST00000366792 WDR62O43379 1518 aa37.82■■■■□ 3.64
PARP1-202ENST00000366792 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
PARP1-202ENST00000366792 TOPBP1Q92547 1522 aa37.39■■■■□ 3.58
PARP1-202ENST00000366792 ABCC8Q09428 1581 aa37.35■■■■□ 3.57
PARP1-202ENST00000366792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.34■■■■□ 3.57
PARP1-202ENST00000366792 IFT140Q96RY7 1462 aa37.17■■■■□ 3.54
PARP1-202ENST00000366792 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.16■■■■□ 3.54
PARP1-202ENST00000366792 CUX1P39880 1505 aa37.06■■■■□ 3.52
PARP1-202ENST00000366792 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
PARP1-202ENST00000366792 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
PARP1-202ENST00000366792 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PARP1-202ENST00000366792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.97■■■■□ 3.51
PARP1-202ENST00000366792 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.91■■■■□ 3.5
PARP1-202ENST00000366792 SOGA1O94964 1423 aa36.91■■■■□ 3.5
PARP1-202ENST00000366792 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
PARP1-202ENST00000366792 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.487e-7■■■□□ 16.8
PARP1-202ENST00000366792 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
PARP1-202ENST00000366792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PARP1-202ENST00000366792 TOP2BQ02880 1626 aa36.7■■■■□ 3.47
PARP1-202ENST00000366792 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.7■■■■□ 3.47
PARP1-202ENST00000366792 SYNJ1O43426 1573 aa36.7■■■■□ 3.47
PARP1-202ENST00000366792 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
PARP1-202ENST00000366792 OSCARQ8IYS5 282 aa36.61■■■■□ 3.45
PARP1-202ENST00000366792 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.58■■■■□ 3.45
PARP1-202ENST00000366792 GRIN2BQ13224 1484 aa36.49■■■■□ 3.43
PARP1-202ENST00000366792 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.48■■■■□ 3.43
PARP1-202ENST00000366792 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.48■■■■□ 3.43
PARP1-202ENST00000366792 CHD1O14646 1710 aa36.48■■■■□ 3.43
PARP1-202ENST00000366792 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.46■■■■□ 3.43
PARP1-202ENST00000366792 PBRM1Q86U86 1689 aa36.45■■■■□ 3.42
PARP1-202ENST00000366792 FBLN2P98095 1184 aa36.44■■■■□ 3.42
PARP1-202ENST00000366792 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PARP1-202ENST00000366792 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
PARP1-202ENST00000366792 SYNJ2O15056 1496 aa36.26■■■■□ 3.4
PARP1-202ENST00000366792 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.14■■■■□ 3.38
PARP1-202ENST00000366792 ADAMTS12P58397 1594 aa36.14■■■■□ 3.38
PARP1-202ENST00000366792 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.05■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 ARHGEF11O15085 1522 aa36.03■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 GRIN2AQ12879 1464 aa36.03■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.03■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 KIF27Q86VH2 1401 aa36.02■■■■□ 3.36
PARP1-202ENST00000366792 TRIM41Q8WV44 630 aa35.99■■■■□ 3.35
PARP1-202ENST00000366792 CEP170Q5SW79 1584 aa35.86■■■■□ 3.33
PARP1-202ENST00000366792 IGF1RP08069 1367 aa35.86■■■■□ 3.33
PARP1-202ENST00000366792 NUP160Q12769 1436 aa35.84■■■■□ 3.33
PARP1-202ENST00000366792 CUL7Q14999 1698 aa35.81■■■■□ 3.32
PARP1-202ENST00000366792 ARAP1Q96P48 1450 aa35.73■■■■□ 3.31
PARP1-202ENST00000366792 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.72■■■■□ 3.31
PARP1-202ENST00000366792 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.66■■■■□ 3.3
PARP1-202ENST00000366792 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.66■■■■□ 3.3
PARP1-202ENST00000366792 SHROOM2Q13796 1616 aa35.6■■■■□ 3.29
PARP1-202ENST00000366792 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.8 ms