RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.47■■■■■ 5.83
CHST6-202ENST00000390664 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.89■■■■■ 4.78
CHST6-202ENST00000390664 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
CHST6-202ENST00000390664 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.54■■■■■ 4.4
CHST6-202ENST00000390664 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.47■■■■■ 4.39
CHST6-202ENST00000390664 ABCC9O60706 1549 aa42.32■■■■■ 4.37
CHST6-202ENST00000390664 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.09■■■■■ 4.33
CHST6-202ENST00000390664 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.98■■■■■ 4.31
CHST6-202ENST00000390664 NACADO15069 1562 aa41.74■■■■■ 4.27
CHST6-202ENST00000390664 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.38■■■■■ 4.21
CHST6-202ENST00000390664 SCRIBQ14160 1630 aa41.31■■■■■ 4.2
CHST6-202ENST00000390664 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.67■■■■■ 4.1
CHST6-202ENST00000390664 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CHST6-202ENST00000390664 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.13■■■■■ 4.01
CHST6-202ENST00000390664 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.98■■■■□ 3.99
CHST6-202ENST00000390664 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
CHST6-202ENST00000390664 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.98
CHST6-202ENST00000390664 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.78■■■■□ 3.96
CHST6-202ENST00000390664 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CHST6-202ENST00000390664 SMARCA4P51532 1647 aa39.59■■■■□ 3.93
CHST6-202ENST00000390664 WIZO95785 1651 aa39.52■■■■□ 3.92
CHST6-202ENST00000390664 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.07■■■■□ 3.85
CHST6-202ENST00000390664 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
CHST6-202ENST00000390664 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
CHST6-202ENST00000390664 SMARCA2P51531 1590 aa38.87■■■■□ 3.81
CHST6-202ENST00000390664 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.85■■■■□ 3.81
CHST6-202ENST00000390664 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.81■■■■□ 3.8
CHST6-202ENST00000390664 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
CHST6-202ENST00000390664 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.64■■■■□ 3.78
CHST6-202ENST00000390664 HMGXB3Q12766 1538 aa38.49■■■■□ 3.75
CHST6-202ENST00000390664 NCAPD3P42695 1498 aa38.48■■■■□ 3.75
CHST6-202ENST00000390664 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.33■■■■□ 3.73
CHST6-202ENST00000390664 TRIM41Q8WV44 630 aa38.08■■■■□ 3.69
CHST6-202ENST00000390664 ABCC8Q09428 1581 aa37.92■■■■□ 3.66
CHST6-202ENST00000390664 CFTRP13569 1480 aa37.68■■■■□ 3.62
CHST6-202ENST00000390664 PRDM2Q13029 1718 aa37.65■■■■□ 3.62
CHST6-202ENST00000390664 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.62■■■■□ 3.61
CHST6-202ENST00000390664 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.51■■■■□ 3.59
CHST6-202ENST00000390664 SYNJ1O43426 1573 aa37.51■■■■□ 3.59
CHST6-202ENST00000390664 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
CHST6-202ENST00000390664 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.34■■■■□ 3.57
CHST6-202ENST00000390664 TOP2BQ02880 1626 aa37.34■■■■□ 3.57
CHST6-202ENST00000390664 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.32■■■■□ 3.56
CHST6-202ENST00000390664 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.25■■■■□ 3.55
CHST6-202ENST00000390664 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.22■■■■□ 3.55
CHST6-202ENST00000390664 NESP48681 1621 aa37.2■■■■□ 3.54
CHST6-202ENST00000390664 CUX1P39880 1505 aa37.19■■■■□ 3.54
CHST6-202ENST00000390664 SOGA1O94964 1423 aa37.18■■■■□ 3.54
CHST6-202ENST00000390664 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.53
CHST6-202ENST00000390664 EEA1Q15075 1411 aa37.12■■■■□ 3.53
CHST6-202ENST00000390664 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.04■■■■□ 3.52
CHST6-202ENST00000390664 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.9■■■■□ 3.5
CHST6-202ENST00000390664 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.9■■■■□ 3.5
CHST6-202ENST00000390664 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.88■■■■□ 3.49
CHST6-202ENST00000390664 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.88■■■■□ 3.49
CHST6-202ENST00000390664 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.84■■■■□ 3.49
CHST6-202ENST00000390664 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.83■■■■□ 3.49
CHST6-202ENST00000390664 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.78■■■■□ 3.48
CHST6-202ENST00000390664 TOPBP1Q92547 1522 aa36.75■■■■□ 3.47
CHST6-202ENST00000390664 KIF21BO75037 1637 aa36.69■■■■□ 3.46
CHST6-202ENST00000390664 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
CHST6-202ENST00000390664 KIF27Q86VH2 1401 aa36.65■■■■□ 3.46
CHST6-202ENST00000390664 GOLGA3Q08378 1498 aa36.64■■■■□ 3.46
CHST6-202ENST00000390664 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CHST6-202ENST00000390664 CUX2O14529 1486 aa36.55■■■■□ 3.44
CHST6-202ENST00000390664 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.51■■■■□ 3.43
CHST6-202ENST00000390664 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CHST6-202ENST00000390664 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.45■■■■□ 3.43
CHST6-202ENST00000390664 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.44■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.43■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 PRXQ9BXM0 1461 aa36.42■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.41■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 WDR97A6NE52 1622 aa36.39■■■■□ 3.42
CHST6-202ENST00000390664 CEP162Q5TB80 1403 aa36.36■■■■□ 3.41
CHST6-202ENST00000390664 ERCC6Q03468 1493 aa36.29■■■■□ 3.4
CHST6-202ENST00000390664 IGF1RP08069 1367 aa36.27■■■■□ 3.4
CHST6-202ENST00000390664 WDR62O43379 1518 aa36.25■■■■□ 3.39
CHST6-202ENST00000390664 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CHST6-202ENST00000390664 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.18■■■■□ 3.38
CHST6-202ENST00000390664 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CHST6-202ENST00000390664 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.12■■■■□ 3.37
CHST6-202ENST00000390664 CUL7Q14999 1698 aa36.1■■■■□ 3.37
CHST6-202ENST00000390664 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
CHST6-202ENST00000390664 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.06■■■■□ 3.36
CHST6-202ENST00000390664 CLIP1P30622 1438 aa36.05■■■■□ 3.36
CHST6-202ENST00000390664 IFT140Q96RY7 1462 aa35.98■■■■□ 3.35
CHST6-202ENST00000390664 PBRM1Q86U86 1689 aa35.95■■■■□ 3.35
CHST6-202ENST00000390664 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CHST6-202ENST00000390664 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
CHST6-202ENST00000390664 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CHST6-202ENST00000390664 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.77■■■■□ 3.32
CHST6-202ENST00000390664 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.76■■■■□ 3.31
CHST6-202ENST00000390664 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.75■■■■□ 3.31
CHST6-202ENST00000390664 GRIN2BQ13224 1484 aa35.75■■■■□ 3.31
CHST6-202ENST00000390664 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CHST6-202ENST00000390664 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CHST6-202ENST00000390664 ADAMTS12P58397 1594 aa35.69■■■■□ 3.3
CHST6-202ENST00000390664 ARAP1Q96P48 1450 aa35.69■■■■□ 3.3
CHST6-202ENST00000390664 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms