RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636935.1

CPT2-209, Transcript of carnitine palmitoyltransferase 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPT2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT2-209ENST00000636935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.89■■■■■ 5.9
CPT2-209ENST00000636935 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.1■■■■■ 4.97
CPT2-209ENST00000636935 ABCC9O60706 1549 aa44.82■■■■■ 4.77
CPT2-209ENST00000636935 NACADO15069 1562 aa43.32■■■■■ 4.52
CPT2-209ENST00000636935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.29■■■■■ 4.52
CPT2-209ENST00000636935 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
CPT2-209ENST00000636935 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
CPT2-209ENST00000636935 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.1■■■■■ 4.49
CPT2-209ENST00000636935 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.05■■■■■ 4.48
CPT2-209ENST00000636935 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.26■■■■■ 4.36
CPT2-209ENST00000636935 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.97■■■■■ 4.31
CPT2-209ENST00000636935 SCRIBQ14160 1630 aa41.92■■■■■ 4.3
CPT2-209ENST00000636935 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.29
CPT2-209ENST00000636935 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.66■■■■■ 4.26
CPT2-209ENST00000636935 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.03■■■■■ 4.16
CPT2-209ENST00000636935 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
CPT2-209ENST00000636935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.61■■■■■ 4.09
CPT2-209ENST00000636935 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.34■■■■■ 4.05
CPT2-209ENST00000636935 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
CPT2-209ENST00000636935 SMARCA4P51532 1647 aa40.2■■■■■ 4.03
CPT2-209ENST00000636935 NCAPD3P42695 1498 aa39.99■■■■□ 3.99
CPT2-209ENST00000636935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.98■■■■□ 3.99
CPT2-209ENST00000636935 SMARCA2P51531 1590 aa39.95■■■■□ 3.99
CPT2-209ENST00000636935 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.94■■■■□ 3.98
CPT2-209ENST00000636935 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.91■■■■□ 3.98
CPT2-209ENST00000636935 HMGXB3Q12766 1538 aa39.79■■■■□ 3.96
CPT2-209ENST00000636935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CPT2-209ENST00000636935 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
CPT2-209ENST00000636935 WIZO95785 1651 aa39.49■■■■□ 3.91
CPT2-209ENST00000636935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
CPT2-209ENST00000636935 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.88■■■■□ 3.81
CPT2-209ENST00000636935 NESP48681 1621 aa38.83■■■■□ 3.81
CPT2-209ENST00000636935 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.79■■■■□ 3.8
CPT2-209ENST00000636935 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.66■■■■□ 3.78
CPT2-209ENST00000636935 ERCC6Q03468 1493 aa38.63■■■■□ 3.77
CPT2-209ENST00000636935 CFTRP13569 1480 aa38.6■■■■□ 3.77
CPT2-209ENST00000636935 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.6■■■■□ 3.77
CPT2-209ENST00000636935 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CPT2-209ENST00000636935 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.39■■■■□ 3.74
CPT2-209ENST00000636935 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.3■■■■□ 3.72
CPT2-209ENST00000636935 PRDM2Q13029 1718 aa38.29■■■■□ 3.72
CPT2-209ENST00000636935 CUX2O14529 1486 aa38.28■■■■□ 3.72
CPT2-209ENST00000636935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
CPT2-209ENST00000636935 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.23■■■■□ 3.71
CPT2-209ENST00000636935 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.16■■■■□ 3.7
CPT2-209ENST00000636935 WDR62O43379 1518 aa38.06■■■■□ 3.68
CPT2-209ENST00000636935 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CPT2-209ENST00000636935 ABCC8Q09428 1581 aa37.8■■■■□ 3.64
CPT2-209ENST00000636935 TOPBP1Q92547 1522 aa37.71■■■■□ 3.63
CPT2-209ENST00000636935 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.69■■■■□ 3.62
CPT2-209ENST00000636935 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.62■■■■□ 3.61
CPT2-209ENST00000636935 CUX1P39880 1505 aa37.47■■■■□ 3.59
CPT2-209ENST00000636935 IFT140Q96RY7 1462 aa37.46■■■■□ 3.59
CPT2-209ENST00000636935 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
CPT2-209ENST00000636935 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.31■■■■□ 3.56
CPT2-209ENST00000636935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CPT2-209ENST00000636935 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
CPT2-209ENST00000636935 SOGA1O94964 1423 aa37.24■■■■□ 3.55
CPT2-209ENST00000636935 TOP2BQ02880 1626 aa37.21■■■■□ 3.55
CPT2-209ENST00000636935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.21■■■■□ 3.55
CPT2-209ENST00000636935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
CPT2-209ENST00000636935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.18■■■■□ 3.54
CPT2-209ENST00000636935 SYNJ1O43426 1573 aa37.16■■■■□ 3.54
CPT2-209ENST00000636935 WDR97A6NE52 1622 aa37.11■■■■□ 3.53
CPT2-209ENST00000636935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CPT2-209ENST00000636935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
CPT2-209ENST00000636935 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.02■■■■□ 3.52
CPT2-209ENST00000636935 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
CPT2-209ENST00000636935 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.83■■■■□ 3.49
CPT2-209ENST00000636935 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.82■■■■□ 3.49
CPT2-209ENST00000636935 GRIN2BQ13224 1484 aa36.81■■■■□ 3.48
CPT2-209ENST00000636935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CPT2-209ENST00000636935 PBRM1Q86U86 1689 aa36.7■■■■□ 3.47
CPT2-209ENST00000636935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.69■■■■□ 3.46
CPT2-209ENST00000636935 OSCARQ8IYS5 282 aa36.68■■■■□ 3.46
CPT2-209ENST00000636935 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.59■■■■□ 3.45
CPT2-209ENST00000636935 CHD1O14646 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
CPT2-209ENST00000636935 SYNJ2O15056 1496 aa36.56■■■■□ 3.44
CPT2-209ENST00000636935 KIF27Q86VH2 1401 aa36.51■■■■□ 3.44
CPT2-209ENST00000636935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CPT2-209ENST00000636935 FBLN2P98095 1184 aa36.47■■■■□ 3.43
CPT2-209ENST00000636935 TRIM41Q8WV44 630 aa36.46■■■■□ 3.43
CPT2-209ENST00000636935 ADAMTS12P58397 1594 aa36.44■■■■□ 3.42
CPT2-209ENST00000636935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.42■■■■□ 3.42
CPT2-209ENST00000636935 IGF1RP08069 1367 aa36.37■■■■□ 3.41
CPT2-209ENST00000636935 GRIN2AQ12879 1464 aa36.33■■■■□ 3.41
CPT2-209ENST00000636935 CUL7Q14999 1698 aa36.26■■■■□ 3.39
CPT2-209ENST00000636935 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.25■■■■□ 3.39
CPT2-209ENST00000636935 NUP160Q12769 1436 aa36.21■■■■□ 3.39
CPT2-209ENST00000636935 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.15■■■■□ 3.38
CPT2-209ENST00000636935 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.14■■■■□ 3.38
CPT2-209ENST00000636935 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.13■■■■□ 3.37
CPT2-209ENST00000636935 CEP170Q5SW79 1584 aa36.11■■■■□ 3.37
CPT2-209ENST00000636935 ARHGEF11O15085 1522 aa36.07■■■■□ 3.36
CPT2-209ENST00000636935 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.04■■■■□ 3.36
CPT2-209ENST00000636935 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.04■■■■□ 3.36
CPT2-209ENST00000636935 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.04■■■■□ 3.36
CPT2-209ENST00000636935 EEA1Q15075 1411 aa35.97■■■■□ 3.35
CPT2-209ENST00000636935 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.94■■■■□ 3.34
CPT2-209ENST00000636935 SHROOM2Q13796 1616 aa35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms