RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460298.3

IQCJ-SCHIP1-202, Transcript of IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene IQCJ-SCHIP1, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.42■■■■■ 5.82
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.98■■■■■ 4.79
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ABCC9O60706 1549 aa42.61■■■■■ 4.41
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.54■■■■■ 4.4
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.49■■■■■ 4.39
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.09■■■■■ 4.33
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 NACADO15069 1562 aa41.9■■■■■ 4.3
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.79■■■■■ 4.28
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.59■■■■■ 4.25
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SCRIBQ14160 1630 aa41.3■■■■■ 4.2
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.78■■■■■ 4.12
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.31■■■■■ 4.04
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.94■■■■□ 3.98
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.71■■■■□ 3.95
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 WIZO95785 1651 aa39.41■■■■□ 3.9
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.11■■■■□ 3.85
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SMARCA2P51531 1590 aa38.96■■■■□ 3.83
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.94■■■■□ 3.82
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 NCAPD3P42695 1498 aa38.64■■■■□ 3.78
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 HMGXB3Q12766 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.59■■■■□ 3.77
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.57■■■■□ 3.76
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.32■■■■□ 3.73
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TRIM41Q8WV44 630 aa37.77■■■■□ 3.64
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CFTRP13569 1480 aa37.74■■■■□ 3.63
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ABCC8Q09428 1581 aa37.71■■■■□ 3.63
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.67■■■■□ 3.62
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PRDM2Q13029 1718 aa37.64■■■■□ 3.62
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.64■■■■□ 3.62
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.39■■■■□ 3.58
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 NESP48681 1621 aa37.35■■■■□ 3.57
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SYNJ1O43426 1573 aa37.35■■■■□ 3.57
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.24■■■■□ 3.55
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TOP2BQ02880 1626 aa37.23■■■■□ 3.55
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.21■■■■□ 3.55
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CUX1P39880 1505 aa37.15■■■■□ 3.54
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.09■■■■□ 3.53
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.03■■■■□ 3.52
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.97■■■■□ 3.51
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SOGA1O94964 1423 aa36.94■■■■□ 3.5
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.89■■■■□ 3.5
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 EEA1Q15075 1411 aa36.88■■■■□ 3.49
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.84■■■■□ 3.49
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TOPBP1Q92547 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.81■■■■□ 3.48
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.77■■■■□ 3.48
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.67■■■■□ 3.46
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.63■■■■□ 3.45
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ERCC6Q03468 1493 aa36.58■■■■□ 3.45
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 KIF27Q86VH2 1401 aa36.57■■■■□ 3.44
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.52■■■■□ 3.44
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CUX2O14529 1486 aa36.5■■■■□ 3.43
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.48■■■■□ 3.43
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.45■■■■□ 3.43
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 WDR62O43379 1518 aa36.44■■■■□ 3.42
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 KIF21BO75037 1637 aa36.43■■■■□ 3.42
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 WDR97A6NE52 1622 aa36.38■■■■□ 3.41
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 GOLGA3Q08378 1498 aa36.37■■■■□ 3.41
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PRXQ9BXM0 1461 aa36.26■■■■□ 3.4
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 IGF1RP08069 1367 aa36.22■■■■□ 3.39
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.22■■■■□ 3.39
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.21■■■■□ 3.39
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.2■■■■□ 3.39
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.18■■■■□ 3.38
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 IFT140Q96RY7 1462 aa36.16■■■■□ 3.38
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.06■■■■□ 3.36
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CUL7Q14999 1698 aa36.04■■■■□ 3.36
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CEP162Q5TB80 1403 aa35.99■■■■□ 3.35
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 PBRM1Q86U86 1689 aa35.97■■■■□ 3.35
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 GRIN2BQ13224 1484 aa35.85■■■■□ 3.33
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CLIP1P30622 1438 aa35.76■■■■□ 3.32
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ADAMTS12P58397 1594 aa35.73■■■■□ 3.31
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.71■■■■□ 3.31
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.64■■■■□ 3.3
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.63■■■■□ 3.29
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.45■■■■□ 3.27
IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 SYNJ2O15056 1496 aa35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms