Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HHIPQ96QV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HHIPQ96QV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHIPQ96QV1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms