RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.56■■■■■ 6.17
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CDIPT-210ENST00000570016 ABCC9O60706 1549 aa47.02■■■■■ 5.12
CDIPT-210ENST00000570016 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.14■■■■■ 4.82
CDIPT-210ENST00000570016 NACADO15069 1562 aa45.04■■■■■ 4.8
CDIPT-210ENST00000570016 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.75■■■■■ 4.75
CDIPT-210ENST00000570016 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.69■■■■■ 4.74
CDIPT-210ENST00000570016 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
CDIPT-210ENST00000570016 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.39■■■■■ 4.7
CDIPT-210ENST00000570016 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.09■■■■■ 4.65
CDIPT-210ENST00000570016 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
CDIPT-210ENST00000570016 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.83■■■■■ 4.61
CDIPT-210ENST00000570016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.53■■■■■ 4.56
CDIPT-210ENST00000570016 SCRIBQ14160 1630 aa43.47■■■■■ 4.55
CDIPT-210ENST00000570016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.4■■■■■ 4.54
CDIPT-210ENST00000570016 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
CDIPT-210ENST00000570016 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.56■■■■■ 4.4
CDIPT-210ENST00000570016 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.32■■■■■ 4.37
CDIPT-210ENST00000570016 SMARCA4P51532 1647 aa41.62■■■■■ 4.25
CDIPT-210ENST00000570016 NCAPD3P42695 1498 aa41.59■■■■■ 4.25
CDIPT-210ENST00000570016 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
CDIPT-210ENST00000570016 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.51■■■■■ 4.24
CDIPT-210ENST00000570016 SMARCA2P51531 1590 aa41.43■■■■■ 4.22
CDIPT-210ENST00000570016 HMGXB3Q12766 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
CDIPT-210ENST00000570016 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.31■■■■■ 4.2
CDIPT-210ENST00000570016 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.25■■■■■ 4.19
CDIPT-210ENST00000570016 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CDIPT-210ENST00000570016 WIZO95785 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
CDIPT-210ENST00000570016 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CDIPT-210ENST00000570016 NESP48681 1621 aa40.6■■■■■ 4.09
CDIPT-210ENST00000570016 ERCC6Q03468 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
CDIPT-210ENST00000570016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.51■■■■■ 4.08
CDIPT-210ENST00000570016 CUX2O14529 1486 aa40.36■■■■■ 4.05
CDIPT-210ENST00000570016 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CDIPT-210ENST00000570016 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.31■■■■■ 4.04
CDIPT-210ENST00000570016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.23■■■■■ 4.03
CDIPT-210ENST00000570016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CDIPT-210ENST00000570016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.1■■■■■ 4.01
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CDIPT-210ENST00000570016 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.85■■■■□ 3.97
CDIPT-210ENST00000570016 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.83■■■■□ 3.97
CDIPT-210ENST00000570016 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.82■■■■□ 3.96
CDIPT-210ENST00000570016 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.8■■■■□ 3.96
CDIPT-210ENST00000570016 WDR62O43379 1518 aa39.75■■■■□ 3.95
CDIPT-210ENST00000570016 PRDM2Q13029 1718 aa39.64■■■■□ 3.94
CDIPT-210ENST00000570016 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.53■■■■□ 3.92
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CDIPT-210ENST00000570016 ABCC8Q09428 1581 aa39.16■■■■□ 3.86
CDIPT-210ENST00000570016 TOPBP1Q92547 1522 aa39.15■■■■□ 3.86
CDIPT-210ENST00000570016 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.07■■■■□ 3.85
CDIPT-210ENST00000570016 IFT140Q96RY7 1462 aa39■■■■□ 3.83
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
CDIPT-210ENST00000570016 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
CDIPT-210ENST00000570016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
CDIPT-210ENST00000570016 CUX1P39880 1505 aa38.71■■■■□ 3.79
CDIPT-210ENST00000570016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CDIPT-210ENST00000570016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.62■■■■□ 3.77
CDIPT-210ENST00000570016 SOGA1O94964 1423 aa38.61■■■■□ 3.77
CDIPT-210ENST00000570016 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.59■■■■□ 3.77
CDIPT-210ENST00000570016 OSCARQ8IYS5 282 aa38.56■■■■□ 3.76
CDIPT-210ENST00000570016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.55■■■■□ 3.76
CDIPT-210ENST00000570016 WDR97A6NE52 1622 aa38.5■■■■□ 3.75
CDIPT-210ENST00000570016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CDIPT-210ENST00000570016 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.32■■■■□ 3.73
CDIPT-210ENST00000570016 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.31■■■■□ 3.72
CDIPT-210ENST00000570016 TOP2BQ02880 1626 aa38.3■■■■□ 3.72
CDIPT-210ENST00000570016 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.29■■■■□ 3.72
CDIPT-210ENST00000570016 SYNJ1O43426 1573 aa38.24■■■■□ 3.71
CDIPT-210ENST00000570016 GRIN2BQ13224 1484 aa38.22■■■■□ 3.71
CDIPT-210ENST00000570016 CHD1O14646 1710 aa38.21■■■■□ 3.71
CDIPT-210ENST00000570016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.19■■■■□ 3.7
CDIPT-210ENST00000570016 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
CDIPT-210ENST00000570016 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.16■■■■□ 3.7
CDIPT-210ENST00000570016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.15■■■■□ 3.7
CDIPT-210ENST00000570016 PBRM1Q86U86 1689 aa38.08■■■■□ 3.69
CDIPT-210ENST00000570016 FBLN2P98095 1184 aa38.05■■■■□ 3.68
CDIPT-210ENST00000570016 SYNJ2O15056 1496 aa38.02■■■■□ 3.68
CDIPT-210ENST00000570016 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
CDIPT-210ENST00000570016 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
CDIPT-210ENST00000570016 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.98■■■■□ 3.67
CDIPT-210ENST00000570016 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF11O15085 1522 aa37.96■■■■□ 3.67
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM41Q8WV44 630 aa37.9■■■■□ 3.66
CDIPT-210ENST00000570016 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.88■■■■□ 3.66
CDIPT-210ENST00000570016 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.82■■■■□ 3.64
CDIPT-210ENST00000570016 ADAMTS12P58397 1594 aa37.8■■■■□ 3.64
CDIPT-210ENST00000570016 GRIN2AQ12879 1464 aa37.73■■■■□ 3.63
CDIPT-210ENST00000570016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.73■■■■□ 3.63
CDIPT-210ENST00000570016 ARAP1Q96P48 1450 aa37.63■■■■□ 3.61
CDIPT-210ENST00000570016 NUP160Q12769 1436 aa37.62■■■■□ 3.61
CDIPT-210ENST00000570016 CEP170Q5SW79 1584 aa37.55■■■■□ 3.6
CDIPT-210ENST00000570016 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.55■■■■□ 3.6
CDIPT-210ENST00000570016 KIF27Q86VH2 1401 aa37.55■■■■□ 3.6
CDIPT-210ENST00000570016 IGF1RP08069 1367 aa37.48■■■■□ 3.59
CDIPT-210ENST00000570016 CUL7Q14999 1698 aa37.38■■■■□ 3.57
CDIPT-210ENST00000570016 SHROOM2Q13796 1616 aa37.37■■■■□ 3.57
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CDIPT-210ENST00000570016 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.21■■■■□ 3.55
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